More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0772 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 371 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  76 
 
 		 391 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  75.64 
 
 		 349 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  57.32 
 
 		 353 aa  355  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 358 aa  239  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 357 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  29.6 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 815 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 1654 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 746 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  26.06 
 
 		 1239 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.03 
 
 		 744 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 1560 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 771 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 752 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 362 aa  106  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 572 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  35.53 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 991 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 872 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 732 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 771 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 2693 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 1390 aa  100  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 603 aa  100  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 357 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 362 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 941 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 354 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.61 
 
 		 348 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 382 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  32.69 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 551 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 1093 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 1093 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 764 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 532 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 932 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 547 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 526 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 788 aa  96.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 492 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 431 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 834 aa  95.9  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  25.75 
 
 		 918 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 		 613 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 3706 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 1714 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  28.7 
 
 		 475 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  25.37 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 964 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  29.69 
 
 		 783 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 767 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1210 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 747 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  32.05 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 1676 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 913 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 674 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 500 aa  93.6  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 545 aa  93.2  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 461 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  24.16 
 
 		 754 aa  93.2  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 215 aa  93.2  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 721 aa  93.2  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 1177 aa  92.8  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 1051 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 909 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 1253 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  34.38 
 
 		 516 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 1093 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 1183 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 439 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>