168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5674 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 222 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  84.23 
 
 		 222 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  83.33 
 
 		 222 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  79.73 
 
 		 222 aa  390  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  80.63 
 
 		 222 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  77.03 
 
 		 222 aa  381  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  80.18 
 
 		 222 aa  380  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  75.68 
 
 		 222 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  74.43 
 
 		 234 aa  354  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  67.58 
 
 		 221 aa  316  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  65.75 
 
 		 221 aa  309  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  64.84 
 
 		 221 aa  305  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  62.16 
 
 		 222 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  63.06 
 
 		 222 aa  305  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  62.16 
 
 		 222 aa  304  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  62.16 
 
 		 222 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  61.71 
 
 		 222 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  61.71 
 
 		 222 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  63.23 
 
 		 222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  62.33 
 
 		 222 aa  300  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  63.35 
 
 		 223 aa  299  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  60.36 
 
 		 222 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  61.09 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  58.56 
 
 		 222 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  57.66 
 
 		 222 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  57.21 
 
 		 222 aa  278  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  58.11 
 
 		 222 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 279 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  26.77 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  30 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  28.44 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  27.43 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  29.36 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  27.92 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  28.89 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  28.85 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.61 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.39 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  27.51 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.45 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.36 
 
 		 297 aa  65.1  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.36 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.48 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.9 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  22.27 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  21.82 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  25.82 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  25.39 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  24.89 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  28.25 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  32.23 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  24.78 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.86 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  25.65 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  34.96 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  27.36 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  28.02 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  23.48 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  23.44 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  27.07 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  27.55 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  27.03 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  28.24 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  29.27 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  27.55 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  26.07 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  25.22 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  35.29 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  25.6 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  27.36 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  25.35 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  27.92 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  31.93 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  26.29 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  23.28 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.54 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  33.65 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  26.6 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  26.96 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  26.96 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  24.67 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  24.89 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  28.28 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  28.28 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  26.21 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  25.71 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  30.47 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  28.92 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>