More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4080 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  100 
 
 		 565 aa  1159    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 		 1252 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 		 1252 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  30.88 
 
 		 1014 aa  288  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 563 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.94 
 
 		 864 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  30.02 
 
 		 837 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 		 811 aa  220  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0755  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 730 aa  166  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  30.96 
 
 		 784 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.92 
 
 		 589 aa  143  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1085 aa  140  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 718 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 909 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 750 aa  133  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 739 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  25.62 
 
 		 585 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 706 aa  131  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  24.51 
 
 		 2490 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 700 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.56 
 
 		 589 aa  124  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 1007 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 761 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  26.61 
 
 		 699 aa  120  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 754 aa  120  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1094 aa  118  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 4489 aa  118  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  24.82 
 
 		 1221 aa  116  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 3035 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  24.29 
 
 		 797 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 824 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 		 611 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.04 
 
 		 529 aa  109  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 627 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 822 aa  108  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 727 aa  107  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 754 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 667 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 3560 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 1106 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 		 1714 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 968 aa  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 779 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 780 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  26.59 
 
 		 780 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16060  predicted protein  27.14 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 708 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 732 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.95 
 
 		 667 aa  100  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 733 aa  100  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  23.28 
 
 		 715 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2920  hypothetical protein  26.72 
 
 		 696 aa  99.4  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 789 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  26.55 
 
 		 1415 aa  99.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.14 
 
 		 1154 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  38.61 
 
 		 637 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 713 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  52.75 
 
 		 685 aa  98.2  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 619 aa  98.2  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 808 aa  98.2  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  24.64 
 
 		 719 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 750 aa  97.8  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  20.43 
 
 		 708 aa  97.8  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  25.21 
 
 		 747 aa  97.4  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  18.97 
 
 		 632 aa  97.4  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 598 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 654 aa  95.9  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  51.65 
 
 		 681 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 833 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 717 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 717 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 974 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  23.9 
 
 		 590 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 828 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 833 aa  91.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 590 aa  91.3  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  25.41 
 
 		 566 aa  91.3  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  22.24 
 
 		 789 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 828 aa  91.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  22.2 
 
 		 680 aa  90.9  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 739 aa  90.9  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  24.39 
 
 		 781 aa  90.5  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  45.05 
 
 		 878 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1106 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  25.07 
 
 		 745 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  47.56 
 
 		 725 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 828 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  25.3 
 
 		 731 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 633 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  46.15 
 
 		 816 aa  87.4  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.25 
 
 		 810 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  42.39 
 
 		 622 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  50 
 
 		 864 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  41.51 
 
 		 764 aa  86.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  26.44 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.56 
 
 		 632 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  43.96 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  21.74 
 
 		 739 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 626 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  24.7 
 
 		 731 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>