More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3669 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  36.54 
 
 		 1086 aa  638    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  47.54 
 
 		 1128 aa  1032    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  36.58 
 
 		 1100 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1109 aa  2292    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  46.42 
 
 		 1153 aa  1009    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  56.84 
 
 		 1140 aa  1258    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  39.79 
 
 		 853 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  27.02 
 
 		 1131 aa  251  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.77 
 
 		 1016 aa  246  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  27.38 
 
 		 1124 aa  239  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  27.06 
 
 		 1052 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  25.77 
 
 		 1086 aa  235  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  26.76 
 
 		 1086 aa  225  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  25.44 
 
 		 1080 aa  224  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  25.75 
 
 		 1051 aa  214  7e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  25.22 
 
 		 1143 aa  214  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  28.08 
 
 		 1112 aa  213  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  27.04 
 
 		 1153 aa  211  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  27.77 
 
 		 1075 aa  199  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  27.58 
 
 		 1074 aa  196  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  26.98 
 
 		 1075 aa  194  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  28.79 
 
 		 1082 aa  193  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  24.92 
 
 		 1075 aa  192  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  24.83 
 
 		 1127 aa  191  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.88 
 
 		 1085 aa  191  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  28.57 
 
 		 1087 aa  188  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  28.57 
 
 		 1078 aa  186  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  27.38 
 
 		 1081 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  27.97 
 
 		 1077 aa  182  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  28.01 
 
 		 1090 aa  178  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  27.28 
 
 		 1117 aa  176  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  23.73 
 
 		 1099 aa  175  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  26.06 
 
 		 1067 aa  173  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  27.82 
 
 		 1053 aa  173  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  26.14 
 
 		 1077 aa  167  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  26.65 
 
 		 1065 aa  166  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  26.7 
 
 		 1083 aa  166  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  28.55 
 
 		 1065 aa  164  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  24.77 
 
 		 1089 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  25.48 
 
 		 1064 aa  158  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  25.68 
 
 		 1071 aa  157  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  25.54 
 
 		 1072 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  25.84 
 
 		 1077 aa  155  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  25.31 
 
 		 1078 aa  148  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  26.2 
 
 		 1069 aa  146  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  25.73 
 
 		 1160 aa  144  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  24.11 
 
 		 1125 aa  136  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  27.06 
 
 		 1109 aa  110  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  29.72 
 
 		 1122 aa  104  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  28.51 
 
 		 1060 aa  104  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  26.67 
 
 		 696 aa  92.8  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  34.76 
 
 		 941 aa  89  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  34.76 
 
 		 941 aa  89  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  27.01 
 
 		 1065 aa  85.5  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  32.81 
 
 		 962 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  33.87 
 
 		 969 aa  83.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  26.24 
 
 		 1138 aa  83.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  35.29 
 
 		 1043 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  35.09 
 
 		 966 aa  82.8  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  28.34 
 
 		 1069 aa  79.7  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  28.34 
 
 		 1069 aa  79.7  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  28.76 
 
 		 972 aa  79  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  23.8 
 
 		 1172 aa  79  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  31.52 
 
 		 813 aa  79  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  27.42 
 
 		 638 aa  78.6  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  24.79 
 
 		 1160 aa  78.2  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  39.52 
 
 		 933 aa  76.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  21.51 
 
 		 1049 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  36.48 
 
 		 805 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  38.62 
 
 		 950 aa  75.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  25.31 
 
 		 1187 aa  75.1  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  32.7 
 
 		 1046 aa  75.1  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  29.76 
 
 		 1065 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  29.76 
 
 		 1065 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.65 
 
 		 1116 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  33.96 
 
 		 1013 aa  73.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  40.74 
 
 		 1168 aa  73.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  35.29 
 
 		 982 aa  73.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  24.8 
 
 		 801 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  23.13 
 
 		 1170 aa  72.4  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  31.28 
 
 		 541 aa  72.4  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  36.55 
 
 		 968 aa  72  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.47 
 
 		 1147 aa  71.6  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  28.8 
 
 		 889 aa  70.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  32.89 
 
 		 467 aa  70.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  29.64 
 
 		 877 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  24.04 
 
 		 925 aa  70.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0716  helicase domain-containing protein  33.81 
 
 		 819 aa  70.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  35.59 
 
 		 1037 aa  70.1  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  32.34 
 
 		 933 aa  70.1  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  29.31 
 
 		 937 aa  70.1  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  31.98 
 
 		 948 aa  70.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.31 
 
 		 964 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  34.13 
 
 		 584 aa  69.3  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  29.78 
 
 		 937 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.79 
 
 		 1212 aa  68.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.75 
 
 		 1028 aa  68.6  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  39.13 
 
 		 953 aa  68.2  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  34.68 
 
 		 760 aa  68.2  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  31.75 
 
 		 1169 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>