More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2678 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2678  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 480 aa  976    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 		 597 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 573 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  28.89 
 
 		 936 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  29.87 
 
 		 535 aa  143  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  25.92 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 503 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 612 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02816  TPR domain protein  24.6 
 
 		 604 aa  120  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.36083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 1094 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 		 614 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  36.2 
 
 		 626 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  35.75 
 
 		 626 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  35.75 
 
 		 614 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  35.75 
 
 		 614 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 		 614 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.94 
 
 		 632 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  25.28 
 
 		 594 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 		 878 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 1252 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.86 
 
 		 626 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 3145 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 		 1252 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.03 
 
 		 810 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 4489 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.36 
 
 		 875 aa  100  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 3035 aa  99  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1811  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 596 aa  98.6  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.541585  normal  0.135887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 465 aa  97.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.89 
 
 		 622 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0817  hypothetical protein  24.12 
 
 		 467 aa  94  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00165108  unclonable  0.0000072103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 265 aa  93.6  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 739 aa  93.2  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.7 
 
 		 764 aa  93.6  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 614 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 718 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 542 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 3560 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 1406 aa  90.5  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 612 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  34.57 
 
 		 864 aa  90.1  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 681 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 909 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 639 aa  89.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 2262 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 635 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 635 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 636 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  30.35 
 
 		 703 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  27.24 
 
 		 587 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 		 1737 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 637 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 3301 aa  87.4  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30.21 
 
 		 865 aa  87  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.04 
 
 		 725 aa  87  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 611 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 637 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 620 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.35 
 
 		 795 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  31.92 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 2262 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.44 
 
 		 816 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 714 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 808 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.35 
 
 		 1154 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3142  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 504 aa  85.1  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 685 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 		 732 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  32.16 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 3172 aa  83.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 689 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 750 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 615 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.21 
 
 		 887 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.56 
 
 		 620 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 279 aa  82.4  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1827 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.69 
 
 		 714 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 847 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 		 1486 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  32.27 
 
 		 503 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 827 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 602 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.98 
 
 		 603 aa  80.1  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 649 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 649 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 265 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  33.04 
 
 		 395 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 649 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.26 
 
 		 676 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 562 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 648 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 646 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  24.9 
 
 		 661 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  22.63 
 
 		 832 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  28.51 
 
 		 566 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  30.32 
 
 		 780 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>