180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04883 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  100 
 
 		 494 aa  982    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1613  spermine synthase  33.4 
 
 		 753 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0627097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0785  putative spermidine synthase  33.33 
 
 		 759 aa  205  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2535  putative spermidine synthase  32.39 
 
 		 765 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2651  putative spermidine synthase  35.5 
 
 		 765 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  27.47 
 
 		 1078 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  27.25 
 
 		 1078 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1079 aa  86.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  24.64 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  25.68 
 
 		 837 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  24.38 
 
 		 749 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  25.32 
 
 		 1017 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  35.38 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  35.38 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  25.18 
 
 		 982 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  35.38 
 
 		 284 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  28.1 
 
 		 289 aa  72  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4736  spermidine synthase  28.57 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  25.12 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2119  spermine synthase  26.27 
 
 		 903 aa  70.5  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0594434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0816  spermidine synthase  30.68 
 
 		 504 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072046  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  26.03 
 
 		 503 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3473  spermidine synthase  30.11 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5393  spermidine synthase  30.11 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.377907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4893  spermidine synthase  30.11 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.737239  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  29.36 
 
 		 307 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  32.56 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  24.47 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  32.49 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  31.78 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  28.57 
 
 		 983 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  33.08 
 
 		 286 aa  67  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  25.65 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  23.78 
 
 		 782 aa  66.6  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5266  spermidine synthase  34.53 
 
 		 514 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  31.79 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4785  spermidine synthase  32.37 
 
 		 527 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  28.42 
 
 		 757 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  31.67 
 
 		 521 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5606  Spermine synthase  25.11 
 
 		 758 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  31.67 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  25.25 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  32.35 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  26.44 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0249  spermidine synthase  32.91 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  31.54 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  27.22 
 
 		 991 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4800  spermidine synthase  31.33 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  27.66 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  25.85 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  32 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4273  spermidine synthase  30 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0733287 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  28.28 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  29.38 
 
 		 803 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  29.94 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  27.52 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  26 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  29.66 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  30.58 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  29.55 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  32.56 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  28.98 
 
 		 525 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1337  spermidine synthase  28.98 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  28.41 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0905  Spermine synthase  31.19 
 
 		 805 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0140843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  28.41 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  28.57 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  22.51 
 
 		 835 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  34.33 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  30.67 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  30.94 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  26.21 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  30.56 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  30.09 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  28.86 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  29.63 
 
 		 548 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  33.61 
 
 		 286 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  25.48 
 
 		 836 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  30 
 
 		 292 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  27.82 
 
 		 375 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30.97 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  29.41 
 
 		 304 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  29.61 
 
 		 291 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  30.23 
 
 		 279 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5060  spermidine synthase  27.82 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5301  spermidine synthase  26.42 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000883431 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5445  spermidine synthase  27.82 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  25.15 
 
 		 844 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  27.46 
 
 		 278 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2930  spermidine synthase  33.33 
 
 		 275 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5627  spermidine synthase  26.42 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000165937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  28.48 
 
 		 819 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  23.65 
 
 		 541 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  30.41 
 
 		 316 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  26.11 
 
 		 558 aa  54.7  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  31.97 
 
 		 286 aa  54.7  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4905  spermidine synthase  26.42 
 
 		 369 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  28.23 
 
 		 291 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4890  spermidine synthase  27.82 
 
 		 405 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  31.33 
 
 		 528 aa  54.3  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>