More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01214 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  100 
 
 		 469 aa  946    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  77.51 
 
 		 469 aa  729    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  84.25 
 
 		 475 aa  772    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  77.61 
 
 		 469 aa  744    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  64.05 
 
 		 465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  65.27 
 
 		 456 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  64.99 
 
 		 462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  61.79 
 
 		 469 aa  552  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  61 
 
 		 461 aa  547  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  60.78 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  58.98 
 
 		 460 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  61.87 
 
 		 459 aa  547  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  56.55 
 
 		 464 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 461 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  60.94 
 
 		 448 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  61.5 
 
 		 458 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  61 
 
 		 459 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  61.22 
 
 		 459 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  61.44 
 
 		 459 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  56.18 
 
 		 462 aa  527  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  60.79 
 
 		 458 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  60.79 
 
 		 458 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  58.44 
 
 		 463 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  59.25 
 
 		 458 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 458 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  56.46 
 
 		 456 aa  510  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  58.54 
 
 		 459 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  56.89 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  57.87 
 
 		 457 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  57.08 
 
 		 457 aa  501  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  59.34 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  57.08 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  59.17 
 
 		 462 aa  495  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  55.31 
 
 		 463 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  55.98 
 
 		 469 aa  484  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  55.97 
 
 		 465 aa  478  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  58.9 
 
 		 458 aa  481  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  52.83 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  52.39 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  52.83 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  50.75 
 
 		 469 aa  465  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  51.08 
 
 		 467 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  54.92 
 
 		 465 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  54.97 
 
 		 466 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  50.11 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  53.39 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  54.52 
 
 		 473 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  56.07 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  53.28 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  52.4 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  52.94 
 
 		 476 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  51.39 
 
 		 475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  52.53 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  51.21 
 
 		 457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  51.09 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  55.46 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  50.85 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  47.29 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  52.55 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  48.81 
 
 		 469 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  51.95 
 
 		 464 aa  435  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  48.37 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  52.08 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  49.77 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  52.08 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  53.9 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 459 aa  438  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 474 aa  438  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  52.08 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  47.2 
 
 		 469 aa  432  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  50.11 
 
 		 471 aa  435  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 473 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  53.79 
 
 		 464 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  49.24 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  52.6 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  52.07 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  52.21 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  46.74 
 
 		 475 aa  427  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  51.96 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  45.83 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  51.3 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  50 
 
 		 468 aa  423  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  50.59 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 466 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  45.61 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  53.02 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  46.46 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  44.57 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  44.96 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  47.28 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  46.52 
 
 		 471 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  46.46 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  45.18 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  45.63 
 
 		 464 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  46.36 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18661  fumarate hydratase  43.91 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04621  fumarate hydratase  47.51 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>