More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43897 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  100 
 
 		 2125 aa  4273    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_55138  cell surface protein  36.14 
 
 		 489 aa  140  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177713  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2545  hemolysin-type calcium-binding region  25.34 
 
 		 4451 aa  134  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.15154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  25.34 
 
 		 7072 aa  132  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.971517 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39615  predicted protein  32.75 
 
 		 355 aa  107  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  41.06 
 
 		 1883 aa  93.2  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  42.42 
 
 		 2768 aa  91.3  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  24.85 
 
 		 3333 aa  91.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  28.16 
 
 		 5123 aa  87  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  41.73 
 
 		 4285 aa  85.9  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  36.55 
 
 		 6211 aa  85.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  24.9 
 
 		 2251 aa  84.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  38.76 
 
 		 5442 aa  81.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.06 
 
 		 2812 aa  79.3  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.33 
 
 		 5787 aa  77.4  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  40.54 
 
 		 2542 aa  77  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.22 
 
 		 2239 aa  77  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.27 
 
 		 5962 aa  77  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  39.19 
 
 		 4678 aa  76.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  25.22 
 
 		 2329 aa  75.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  37.31 
 
 		 542 aa  75.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.22 
 
 		 6683 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  38.52 
 
 		 8321 aa  75.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  42.22 
 
 		 6662 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 		 5839 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  36.92 
 
 		 5444 aa  74.7  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  42.22 
 
 		 6779 aa  75.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  41.46 
 
 		 5218 aa  74.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  39.73 
 
 		 1699 aa  73.6  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  36.91 
 
 		 6753 aa  72  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  37.5 
 
 		 4848 aa  70.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  35.1 
 
 		 2743 aa  71.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.16 
 
 		 2678 aa  70.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.22 
 
 		 4836 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.37 
 
 		 1180 aa  70.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  44.55 
 
 		 5171 aa  70.5  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  38.3 
 
 		 2452 aa  69.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  36.91 
 
 		 8682 aa  69.7  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  48.84 
 
 		 1055 aa  69.7  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  25.68 
 
 		 3263 aa  69.7  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  35.8 
 
 		 2704 aa  69.7  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  36.91 
 
 		 9030 aa  69.7  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  34.65 
 
 		 4214 aa  69.3  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  42 
 
 		 1610 aa  68.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  55.71 
 
 		 850 aa  68.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  42.61 
 
 		 652 aa  68.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  33.33 
 
 		 7679 aa  67.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  46.59 
 
 		 1019 aa  68.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.76 
 
 		 4220 aa  68.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  34.29 
 
 		 2890 aa  67.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  39.84 
 
 		 1839 aa  67.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  43.4 
 
 		 2701 aa  68.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  41.49 
 
 		 1610 aa  67.4  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  37.06 
 
 		 2336 aa  67  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  45.87 
 
 		 202 aa  66.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  45.87 
 
 		 202 aa  66.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  45.45 
 
 		 1538 aa  66.6  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  33.33 
 
 		 7919 aa  66.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  38.19 
 
 		 515 aa  66.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  53.16 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.81 
 
 		 2346 aa  65.9  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  39.47 
 
 		 4106 aa  65.9  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  36 
 
 		 2524 aa  65.9  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  46.99 
 
 		 917 aa  65.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  38.52 
 
 		 4791 aa  65.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  45.61 
 
 		 998 aa  65.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  42.52 
 
 		 1079 aa  64.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  47.06 
 
 		 16322 aa  63.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  39.32 
 
 		 686 aa  63.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  35.76 
 
 		 1166 aa  63.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.62 
 
 		 1073 aa  63.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  48.28 
 
 		 448 aa  63.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  45.98 
 
 		 1202 aa  63.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  43.33 
 
 		 621 aa  63.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  43.33 
 
 		 621 aa  63.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 		 1598 aa  63.2  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  44.32 
 
 		 517 aa  63.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  39.84 
 
 		 998 aa  63.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.86 
 
 		 2067 aa  62.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  44.71 
 
 		 523 aa  62.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.243046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  41.28 
 
 		 709 aa  62.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  50.63 
 
 		 565 aa  62.4  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  36.55 
 
 		 3209 aa  62.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.33 
 
 		 4122 aa  61.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  36.88 
 
 		 417 aa  61.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0479  outer membrane adhesin like proteiin  32.84 
 
 		 3229 aa  61.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  44.12 
 
 		 561 aa  61.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  35.77 
 
 		 4854 aa  61.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  44.32 
 
 		 1145 aa  60.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  36.57 
 
 		 476 aa  61.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  38.28 
 
 		 1403 aa  61.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  42.34 
 
 		 516 aa  60.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 260 aa  61.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  36.61 
 
 		 1037 aa  60.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.74 
 
 		 2668 aa  60.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  43.43 
 
 		 357 aa  60.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  46.32 
 
 		 2133 aa  60.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1424 aa  60.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  37.59 
 
 		 9867 aa  60.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2989  hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 		 2469 aa  60.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>