More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1633 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  100 
 
 		 362 aa  743    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  86.19 
 
 		 363 aa  659    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  56.59 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  46.99 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  43.34 
 
 		 425 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  32.95 
 
 		 476 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  32.37 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 367 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2451  putative integrase/recombinase  30.54 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  31.86 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.57 
 
 		 379 aa  93.2  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  27.57 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  28.11 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  28.35 
 
 		 387 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  31.36 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  32.93 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  32.93 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  28.21 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  27.3 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  25.97 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  31.08 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.36 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  27.89 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.92 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  28.51 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  30.68 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  32.39 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  30.83 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  26.06 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  29.83 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  26.5 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  26.06 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  27.93 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.59 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  30.3 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  31.53 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  31.53 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.23 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  26 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  29.84 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  27.18 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  25.47 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  32.6 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  26.02 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.66 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.29 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  24.63 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  25.54 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  28.4 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  25.83 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1508  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  22.72 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  28.18 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  26.37 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  28.71 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  26.47 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  29.5 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  28.48 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  30.22 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  26.73 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  27.27 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  30.45 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3066  integrase  31.82 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0315896  hitchhiker  0.000000103666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.7 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  29.18 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  30.34 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  30.34 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  30.26 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  31.03 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  24.9 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  28.63 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.92 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  31.61 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  27.94 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  32.32 
 
 		 172 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  25.7 
 
 		 313 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  26.13 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  30.48 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  29.33 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.12 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.12 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  30.04 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  24.92 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  35.67 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  26.11 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  23.25 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.22 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  33.33 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3119  integrase family protein  26.22 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  30 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>