More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1842 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  34.91 
 
 		 1055 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1063 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1063 aa  643    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1063 aa  643    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1063 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1098 aa  2208    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  35.05 
 
 		 1048 aa  666    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  34.73 
 
 		 1063 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  34.92 
 
 		 1067 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  34.92 
 
 		 1067 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  35.33 
 
 		 1050 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  35.11 
 
 		 1067 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.66 
 
 		 1067 aa  634  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  35.46 
 
 		 1049 aa  634  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.61 
 
 		 1067 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  34.48 
 
 		 1053 aa  630  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  35.37 
 
 		 1052 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.03 
 
 		 1041 aa  583  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1121 aa  572  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.74 
 
 		 1074 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  33.01 
 
 		 1039 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1073 aa  561  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  34.15 
 
 		 1060 aa  561  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  32.73 
 
 		 1044 aa  556  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1060 aa  558  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  33.86 
 
 		 1057 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  33.36 
 
 		 1060 aa  535  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 		 1061 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1032 aa  531  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  33.74 
 
 		 1042 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  32.92 
 
 		 1056 aa  522  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.86 
 
 		 1093 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1051 aa  516  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1072 aa  508  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  30.92 
 
 		 1069 aa  500  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  30.9 
 
 		 1050 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1034 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1038 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  30.17 
 
 		 1053 aa  485  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  29.74 
 
 		 1068 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1052 aa  482  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.42 
 
 		 1075 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.12 
 
 		 1060 aa  458  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 		 1062 aa  459  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 		 1041 aa  456  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.54 
 
 		 1054 aa  442  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1033 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  27.38 
 
 		 1041 aa  435  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1033 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 		 1066 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1041 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 		 1030 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1053 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  28.19 
 
 		 1034 aa  405  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  28.28 
 
 		 1053 aa  402  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1063 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  28.63 
 
 		 1071 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1035 aa  399  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  27.51 
 
 		 1036 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  27.6 
 
 		 1054 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1033 aa  386  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  28.84 
 
 		 1074 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  29.89 
 
 		 1048 aa  386  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  29.34 
 
 		 1048 aa  379  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  27.76 
 
 		 1035 aa  379  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1053 aa  353  8e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1040 aa  352  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  27.43 
 
 		 1050 aa  340  7e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1043 aa  337  7e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1054 aa  332  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 		 1035 aa  328  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1064 aa  320  7e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1030 aa  304  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1043 aa  293  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1050 aa  284  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.72 
 
 		 1043 aa  277  8e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  25.8 
 
 		 1041 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  23.11 
 
 		 1058 aa  276  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.7 
 
 		 1044 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  25.16 
 
 		 1092 aa  273  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1028 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  22.53 
 
 		 1057 aa  269  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  24.29 
 
 		 1063 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.17 
 
 		 1034 aa  266  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1028 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1042 aa  266  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  25.47 
 
 		 1053 aa  264  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  24.95 
 
 		 1036 aa  264  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  24.84 
 
 		 1030 aa  264  6.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  23.8 
 
 		 1011 aa  263  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 1025 aa  261  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  24.1 
 
 		 1191 aa  261  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  24.13 
 
 		 1058 aa  260  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1043 aa  259  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1055 aa  259  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 		 1137 aa  258  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1034 aa  257  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  24.91 
 
 		 1059 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  24.27 
 
 		 1031 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1009 aa  255  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>