More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3418 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  100 
 
 
133 aa  263  4e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  69.17 
 
 
133 aa  180  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  48.2 
 
 
144 aa  94.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  43.06 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  42.28 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  40.85 
 
 
144 aa  90.1  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  39.55 
 
 
207 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  41.38 
 
 
150 aa  87  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  39.42 
 
 
290 aa  86.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  40.3 
 
 
208 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  40.69 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  43.7 
 
 
415 aa  84  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.57 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  38.93 
 
 
156 aa  82  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  41.96 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  40.27 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  36.88 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  40.69 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  38.81 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  37.41 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  41.13 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  40 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  42.07 
 
 
307 aa  77.8  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  40.43 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  46.85 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  37.14 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  42.86 
 
 
281 aa  77  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  36.17 
 
 
150 aa  77  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.43 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  37.41 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  41.73 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  33.1 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  37.32 
 
 
301 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  38.13 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.91 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.17 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  32.12 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
144 aa  67  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
145 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  35.66 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  36.88 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  33.13 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  38.41 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  40.29 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  34.51 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  40.43 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  35.92 
 
 
287 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  34.29 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  35.46 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35.17 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  32.65 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  33.78 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  35.21 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  37.96 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
158 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  34.75 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.21 
 
 
149 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  38.73 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.57 
 
 
157 aa  60.1  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  31.43 
 
 
145 aa  60.5  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.88 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.31 
 
 
305 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.27 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0067  UspA domain protein  40.16 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0416151  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.65 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.12 
 
 
300 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  34.31 
 
 
294 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  30.56 
 
 
301 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  38.19 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  33.09 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 
147 aa  57  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  30.67 
 
 
145 aa  57  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  32.64 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
142 aa  57  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.79 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.85 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.97 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  32.19 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  35.46 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  29.25 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.21 
 
 
304 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  32.41 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  31.94 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.91 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  38.41 
 
 
283 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>