188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3452 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 227 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  50.67 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  44.5 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  46.12 
 
 		 276 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  45.41 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  48.34 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  44.89 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  43 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  44.24 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  46.7 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  39.11 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  40.5 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  38.36 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  30.36 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 254 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 283 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  35.98 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 261 aa  85.1  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  31.92 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  28.92 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  32.89 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  30.8 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  28.02 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  28.1 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1436  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.940915  normal  0.193535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 311 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  43.28 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6348  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 400 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00107036  hitchhiker  0.00103053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 191 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 208 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  23 
 
 		 197 aa  45.1  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>