153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4277 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4277  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  77.39 
 
 		 202 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  31.07 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  36 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 228 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 187 aa  45.1  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 252 aa  45.1  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  38.18 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.34 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.34 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.34 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  22.41 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  21.3 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  40.96 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  31 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  28.83 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  35.82 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  22.41 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>