104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3717 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3717  putative lipoprotein LpqU  100 
 
 		 242 aa  490  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.875413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5657  putative lipoprotein LpqU  93.39 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5402  putative lipoprotein LpqU  93.39 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.355441 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5352  putative lipoprotein LpqU  98.58 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2804  putative lipoprotein LpqU  94.61 
 
 		 242 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1953  putative lipoprotein LpqU  68.67 
 
 		 249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0514713  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4772  putative lipoprotein LpqU  67.87 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4241  putative lipoprotein LpqU  67.81 
 
 		 252 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4327  putative lipoprotein LpqU  67.81 
 
 		 252 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.295293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4620  putative lipoprotein LpqU  67.81 
 
 		 252 aa  298  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11040  lipoprotein lpqU  68.78 
 
 		 243 aa  294  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0349863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1569  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  52.94 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3191  hypothetical protein  54.26 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24670  hypothetical protein  45.02 
 
 		 282 aa  168  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2794  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  47.95 
 
 		 466 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1583  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  44.94 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0432  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.54 
 
 		 421 aa  141  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288909  hitchhiker  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0362  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.4 
 
 		 425 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4021  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  43.43 
 
 		 289 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0202993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0498  secreted protein  44.38 
 
 		 389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1103  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.86 
 
 		 815 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.792385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2594  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  48.63 
 
 		 298 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6224  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.82 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1757  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  46.89 
 
 		 251 aa  134  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000259317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0669  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.53 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1352  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.98 
 
 		 506 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0065  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  38.62 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0674  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  41.38 
 
 		 434 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.795427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1862  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  42.39 
 
 		 377 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318749  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1645  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  43.98 
 
 		 662 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0719412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0922  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  42.35 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226627  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05000  hypothetical protein  44.19 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32220  hypothetical protein  44.25 
 
 		 453 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11255  hypothetical protein  43.93 
 
 		 411 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0569  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  39.8 
 
 		 417 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0850  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  38.92 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3989  hypothetical protein  38.95 
 
 		 443 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0846215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4063  hypothetical protein  38.95 
 
 		 443 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4003  hypothetical protein  38.95 
 
 		 443 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.785178  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1251  hypothetical protein  43.45 
 
 		 546 aa  111  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2206  lytic transglycosylase, catalytic  40.7 
 
 		 439 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4490  lytic transglycosylase, catalytic  40.7 
 
 		 447 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1074  hypothetical protein  40.27 
 
 		 423 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.81 
 
 		 378 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  38.99 
 
 		 411 aa  86.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5874  hypothetical protein  48.05 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.030306  normal  0.458268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1690  Lytic transglycosylase catalytic  34.46 
 
 		 378 aa  68.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.120979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6778  Membrane-bound lytic murein transglycosylase B- like protein  32.95 
 
 		 429 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  33.33 
 
 		 844 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2302  lytic transglycosylase catalytic  34.81 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  38.66 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  32.37 
 
 		 390 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1666  Lytic transglycosylase catalytic  43.84 
 
 		 906 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  30.68 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  37.23 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3208  lytic transglycosylase, catalytic  41.49 
 
 		 387 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1157  lytic transglycosylase, catalytic  31.11 
 
 		 400 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.798233  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  42.27 
 
 		 346 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2958  lytic murein transglycosylase  48.48 
 
 		 408 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.141235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13211  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.56 
 
 		 355 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.26412 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1797  hypothetical protein  40.86 
 
 		 334 aa  52.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.52212  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  32.5 
 
 		 392 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0858  hypothetical protein  38.95 
 
 		 331 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1802  Lytic transglycosylase catalytic  42.27 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187771  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1448  Lytic transglycosylase catalytic  46.25 
 
 		 362 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0207836  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1644  lytic murein transglycosylase  46.97 
 
 		 407 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2811  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 		 405 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2502  lytic murein transglycosylase  45.45 
 
 		 408 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0535188  normal  0.354927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2304  lytic murein transglycosylase  46.97 
 
 		 407 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0222996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  34.43 
 
 		 445 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2790  lytic murein transglycosylase  46.97 
 
 		 409 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0861684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4006  putative membrane-bound lytic transglycosylase precursor protein, putative signal peptide  45.45 
 
 		 406 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  27 
 
 		 427 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  36.61 
 
 		 454 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8718  hypothetical protein  38.16 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2993  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.11 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3035  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like  36.11 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  45.31 
 
 		 416 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  40.28 
 
 		 541 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  37.04 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  29.69 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.25 
 
 		 354 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  34.23 
 
 		 331 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  33.98 
 
 		 175 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  25.52 
 
 		 433 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0825  membrane-bound lytic murein transglycosylase B-like protein  31.91 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  32.89 
 
 		 327 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  26.56 
 
 		 434 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3420  hypothetical protein  38.27 
 
 		 559 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3483  hypothetical protein  38.27 
 
 		 559 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0351251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  33.03 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2396  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 362 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0276595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2119  lytic murein transglycosylase  37.33 
 
 		 361 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0387524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2008  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 362 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000275571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3449  lytic murein transglycosylase  38.64 
 
 		 442 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3431  hypothetical protein  38.27 
 
 		 559 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574576  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2163  lytic murein transglycosylase, putative  35.53 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281139  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0836  lytic murein transglycosylase, putative  35.53 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0459329  normal  0.93917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  29.66 
 
 		 308 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>