215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2588 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  55.54 
 
 		 682 aa  682    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  100 
 
 		 687 aa  1340    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1103  SMC domain protein  32.94 
 
 		 808 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  25.8 
 
 		 796 aa  59.7  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  21.36 
 
 		 1051 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4566  ATPase involved in DNA repair  25.5 
 
 		 1059 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  35.48 
 
 		 1177 aa  57.8  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1551  SMC domain-containing protein  33 
 
 		 1074 aa  57.4  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00625316 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  45.83 
 
 		 1148 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0003  DNA replication and repair protein RecF  34.39 
 
 		 370 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  31.19 
 
 		 1173 aa  55.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  32.26 
 
 		 1176 aa  55.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  49.02 
 
 		 1185 aa  55.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  32.61 
 
 		 1255 aa  54.7  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  29.09 
 
 		 1187 aa  54.7  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2709  SMC domain protein  25.37 
 
 		 1036 aa  54.3  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  38.57 
 
 		 1204 aa  54.3  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  46.43 
 
 		 1189 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  46.43 
 
 		 1189 aa  53.9  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  46.43 
 
 		 1189 aa  53.9  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  46.43 
 
 		 1189 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  46.43 
 
 		 1189 aa  53.9  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  46.43 
 
 		 1189 aa  53.9  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  46.43 
 
 		 1189 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  46.43 
 
 		 1189 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  46.43 
 
 		 1189 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  46.43 
 
 		 1189 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4596  hypothetical protein  22.75 
 
 		 879 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0852353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.18 
 
 		 1176 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  36.17 
 
 		 1150 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  36.17 
 
 		 1150 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.89 
 
 		 1181 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3688  SMC domain protein  32.22 
 
 		 1081 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860198 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  31.52 
 
 		 1172 aa  52.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  46.43 
 
 		 1189 aa  53.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2051  SMC domain protein  47.92 
 
 		 1080 aa  52.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.380302  normal  0.930097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  41.67 
 
 		 1146 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  35.71 
 
 		 1179 aa  52.4  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  41.18 
 
 		 1184 aa  52.4  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  32.26 
 
 		 1175 aa  52  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  31.37 
 
 		 1403 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0527  SMC domain-containing protein  49.02 
 
 		 784 aa  51.2  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1175 aa  51.2  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  38.57 
 
 		 1187 aa  51.2  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  30.85 
 
 		 1196 aa  50.8  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  41.51 
 
 		 874 aa  50.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1272  hypothetical protein  41.51 
 
 		 874 aa  50.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10080  chromosome segregation protein SMC  37.14 
 
 		 1174 aa  50.8  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.503151  hitchhiker  0.00000182837 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  41.18 
 
 		 980 aa  50.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  46.94 
 
 		 1202 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  38.18 
 
 		 1208 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  43.14 
 
 		 634 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  37.25 
 
 		 365 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  27.55 
 
 		 1148 aa  50.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  37.25 
 
 		 1185 aa  50.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  39.58 
 
 		 1146 aa  50.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  31.18 
 
 		 1176 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  31.17 
 
 		 1198 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  31.25 
 
 		 1176 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  50 
 
 		 695 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  43.14 
 
 		 362 aa  49.7  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  36.92 
 
 		 1177 aa  49.7  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  29.87 
 
 		 1199 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0765  chromosome segregation protein SMC  41.54 
 
 		 1189 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.430738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  47.83 
 
 		 1198 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6942  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1144 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0702595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  39.29 
 
 		 1187 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 		 1177 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 		 1176 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  43.75 
 
 		 1184 aa  49.7  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0977  chromosome segregation protein SMC  41.07 
 
 		 1172 aa  49.7  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  36.92 
 
 		 1190 aa  48.9  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1200 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1199 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  43.64 
 
 		 953 aa  48.9  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  28.57 
 
 		 1199 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.11 
 
 		 1190 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1986  chromosome segregation protein SMC  39.22 
 
 		 1178 aa  48.9  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05690  chromosome segregation protein SMC  47.73 
 
 		 1184 aa  48.9  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.188799  normal  0.418307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0822  SMC protein-like protein  41.3 
 
 		 1100 aa  48.5  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.866363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  48 
 
 		 812 aa  48.5  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1462  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 		 1186 aa  48.1  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0128703  normal  0.569809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  39.29 
 
 		 1163 aa  48.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  29.79 
 
 		 1190 aa  48.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3707  SMC domain-containing protein  40.38 
 
 		 881 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  41.07 
 
 		 1099 aa  48.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1580  SMC domain protein  42.59 
 
 		 818 aa  48.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.338996  normal  0.282314 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  32.61 
 
 		 1164 aa  47.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  31.18 
 
 		 1185 aa  48.1  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0065  SMC domain protein  26.36 
 
 		 985 aa  48.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1882  SMC domain-containing protein  44.9 
 
 		 805 aa  47.8  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0300452  normal  0.0368515 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5366  hypothetical protein  37.74 
 
 		 892 aa  47.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.0115994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2235  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 		 1195 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000934649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2495  condensin subunit Smc  30.11 
 
 		 1222 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.749634  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2640  chromosome segregation protein SMC  41.18 
 
 		 1192 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  35.38 
 
 		 1185 aa  47.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  38.64 
 
 		 1174 aa  47.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  30.11 
 
 		 1217 aa  47.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  45.45 
 
 		 1180 aa  47.8  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  39.22 
 
 		 1187 aa  47.8  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>