More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0169 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  726    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  726    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  99.21 
 
 		 381 aa  721    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  75.13 
 
 		 383 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  79.03 
 
 		 384 aa  534  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  70.28 
 
 		 367 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  55.16 
 
 		 390 aa  349  5e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  50 
 
 		 487 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  49.86 
 
 		 423 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  52.52 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  43.28 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  51.82 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  45.75 
 
 		 421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  46.27 
 
 		 464 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  46.05 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  45.33 
 
 		 421 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  43.64 
 
 		 455 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  47.65 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  49.12 
 
 		 475 aa  239  8e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  44.28 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  45.07 
 
 		 415 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  44 
 
 		 483 aa  224  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  40.27 
 
 		 367 aa  223  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  36.16 
 
 		 477 aa  206  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  39.76 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  40.7 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  39.14 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  42.94 
 
 		 396 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  38.44 
 
 		 429 aa  193  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  38.32 
 
 		 397 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  37.61 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  37.39 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  41.27 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  32.52 
 
 		 435 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  33.52 
 
 		 426 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  32.95 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  34.4 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  35 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  35.59 
 
 		 423 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  37.24 
 
 		 376 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  40.07 
 
 		 384 aa  160  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  35.6 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  35.6 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  34.02 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  39.16 
 
 		 432 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  35.24 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  34.72 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  37.13 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  31.98 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  34.7 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  34.17 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  31.4 
 
 		 476 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2613  protein of unknown function UPF0118  33.57 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  31.65 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  35.49 
 
 		 389 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  32.03 
 
 		 529 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.56 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  31.33 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  28.3 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.24 
 
 		 405 aa  103  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  27.36 
 
 		 361 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  31.09 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.61 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.61 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  27.88 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3314  hypothetical protein  28.73 
 
 		 353 aa  96.7  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  24.87 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.32 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  27.82 
 
 		 436 aa  94.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  28.01 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.36 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.36 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.36 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.36 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.65 
 
 		 354 aa  93.6  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.06 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.06 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  28.29 
 
 		 408 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  32.72 
 
 		 397 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2075  hypothetical protein  31.21 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  34.72 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  28.36 
 
 		 455 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  25.99 
 
 		 361 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  25.99 
 
 		 361 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  27.6 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.14 
 
 		 351 aa  90.5  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.03 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  30.12 
 
 		 371 aa  90.1  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  27.76 
 
 		 388 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  27.74 
 
 		 364 aa  90.1  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  29.36 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2360  hypothetical protein  26.95 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  24.82 
 
 		 435 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  28.94 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  27.86 
 
 		 358 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  29.87 
 
 		 370 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 		 353 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3758  hypothetical protein  27.7 
 
 		 349 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.08 
 
 		 361 aa  86.3  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.87 
 
 		 358 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>