More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0353 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  100 
 
 		 330 aa  662    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  97.88 
 
 		 330 aa  646    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  96.97 
 
 		 330 aa  643    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  83.03 
 
 		 331 aa  566  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  78.25 
 
 		 330 aa  530  1e-149  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.74 
 
 		 326 aa  333  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.5 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  48.37 
 
 		 337 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  49.7 
 
 		 335 aa  317  1e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  53.03 
 
 		 326 aa  315  5e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  48.97 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.06 
 
 		 326 aa  312  4.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  48.97 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  50.45 
 
 		 343 aa  311  9e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  48.68 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  49.56 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  49.4 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  48.66 
 
 		 335 aa  305  7e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.29 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.67 
 
 		 332 aa  298  8e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.98 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.51 
 
 		 360 aa  295  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  50.15 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  45.78 
 
 		 331 aa  286  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  44.31 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  47.45 
 
 		 333 aa  285  8e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.15 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  48.66 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  45.81 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  45.81 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  45.81 
 
 		 336 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  45.81 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  45.51 
 
 		 335 aa  279  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  45.81 
 
 		 335 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  45.81 
 
 		 335 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  45.81 
 
 		 335 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  45.81 
 
 		 335 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  45.51 
 
 		 336 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  45.81 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.31 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  45.51 
 
 		 336 aa  276  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  43.86 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  45.81 
 
 		 335 aa  275  6e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  45.4 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  45.21 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.77 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  45.21 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  43.41 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  43.62 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  45.81 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  43.45 
 
 		 335 aa  265  5.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  43.15 
 
 		 335 aa  265  5.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.37 
 
 		 325 aa  265  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  44.24 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  42.47 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.55 
 
 		 325 aa  262  6.999999999999999e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.81 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.46 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.11 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.67 
 
 		 321 aa  260  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  45.24 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.77 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.189691 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  43.49 
 
 		 336 aa  256  5e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  43.03 
 
 		 335 aa  256  5e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  43.03 
 
 		 335 aa  255  6e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.37 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.2 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.58 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.21 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.9 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.26 
 
 		 356 aa  251  8.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.68 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  44.04 
 
 		 370 aa  250  3e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.02 
 
 		 357 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.35 
 
 		 358 aa  248  9e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.49 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  40.47 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  40 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  42.27 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.74 
 
 		 357 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.74 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  42.86 
 
 		 377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3610  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.37 
 
 		 361 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  37.5 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  41.52 
 
 		 359 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.27 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.3 
 
 		 334 aa  242  5e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  39.3 
 
 		 359 aa  242  7e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  41.97 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.66 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.34 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.13 
 
 		 371 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.82 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  44.51 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.37 
 
 		 356 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6279  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.26 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000172683  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.95 
 
 		 350 aa  239  4e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.98 
 
 		 371 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.29 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  39.55 
 
 		 360 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>