More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1810 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 
961 aa  1941    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.44 
 
 
969 aa  422  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 
1040 aa  412  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 
1020 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 
966 aa  413  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 
948 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 
935 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 
976 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  30.24 
 
 
929 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 
958 aa  360  7e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 
958 aa  360  9e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 
976 aa  346  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 
914 aa  344  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 
907 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 
924 aa  337  7.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 
935 aa  330  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 
981 aa  329  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  29.23 
 
 
966 aa  327  5e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 
907 aa  325  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 
951 aa  319  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 
966 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 
935 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 
935 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 
935 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 
965 aa  313  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 
944 aa  313  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 
966 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 
957 aa  310  8e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
869 aa  307  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 
873 aa  307  8.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 
951 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 
930 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 
930 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 
930 aa  303  9e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 
873 aa  303  9e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 
998 aa  301  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  28.18 
 
 
936 aa  300  7e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 
897 aa  295  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 
933 aa  291  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 
946 aa  288  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 
842 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 
947 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 
964 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 
937 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 
969 aa  283  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 
901 aa  282  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
967 aa  281  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
912 aa  277  7e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 
904 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 
836 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 
841 aa  267  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.95 
 
 
839 aa  267  8e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 
904 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 
904 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
855 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 
938 aa  264  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 
904 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 
843 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 
855 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 
853 aa  258  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 
922 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 
838 aa  252  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 
940 aa  251  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 
853 aa  251  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 
853 aa  251  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 
853 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 
939 aa  248  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  26.55 
 
 
1007 aa  247  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 
1007 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 
1007 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  27.39 
 
 
853 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 
1007 aa  245  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 
1028 aa  243  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 
987 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 
953 aa  230  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 
1015 aa  230  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
1009 aa  227  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 
952 aa  226  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 
1088 aa  224  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 
817 aa  221  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 
876 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
981 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  28.24 
 
 
709 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 
944 aa  214  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 
824 aa  211  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  25.89 
 
 
914 aa  211  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 
861 aa  210  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 
861 aa  210  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 
861 aa  210  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 
849 aa  209  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 
1000 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 
869 aa  207  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
891 aa  205  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 
974 aa  205  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 
910 aa  204  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  24 
 
 
985 aa  202  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 
857 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 
975 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 
868 aa  198  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 
869 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>