184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4010 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  90.35 
 
 		 228 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  90.35 
 
 		 228 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  77.1 
 
 		 212 aa  345  3e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  77.67 
 
 		 220 aa  315  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  71.5 
 
 		 218 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  59.22 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  52.71 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  45.06 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  43.78 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  40.09 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  38.46 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 232 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  43.62 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  36.74 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  41.09 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  50.82 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1062  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0959794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 275 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  26.25 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 195 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3581  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  62.79 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  30.47 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  38.75 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 283 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  32.54 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 233 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3249  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  32.54 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 239 aa  45.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 194 aa  45.1  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  26.21 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00780  hypothetical protein  41.18 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.978873  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0850  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0861  putative DNA-binding transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>