157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2888 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  95.83 
 
 		 217 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  95.83 
 
 		 217 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 226 aa  269  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  61.93 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  56.25 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  52.36 
 
 		 261 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  44.05 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  41.31 
 
 		 236 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  38.99 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  41.67 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 241 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  41.63 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 228 aa  114  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  39.91 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  39.37 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  38.35 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  38.42 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 244 aa  87.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 243 aa  85.5  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  32.65 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  26.46 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 249 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  32.58 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.47 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  25.41 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 311 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.48 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 253 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 259 aa  45.1  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 343 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>