181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0739 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 
233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  83.48 
 
 
239 aa  394  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  75.76 
 
 
234 aa  331  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  78.71 
 
 
203 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  78.71 
 
 
203 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  54.51 
 
 
239 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  54.89 
 
 
346 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  54.89 
 
 
346 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  54.89 
 
 
344 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  54.89 
 
 
336 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  54.43 
 
 
240 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  54.43 
 
 
316 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  55.84 
 
 
240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  49.79 
 
 
241 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  54.47 
 
 
241 aa  236  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  55.08 
 
 
241 aa  236  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  53.19 
 
 
240 aa  235  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  55.79 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  49.57 
 
 
242 aa  232  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  49.36 
 
 
242 aa  231  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  51.29 
 
 
240 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  50.43 
 
 
239 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  53.62 
 
 
240 aa  226  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  48.5 
 
 
241 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  46.75 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  46.75 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  50.86 
 
 
240 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  50.86 
 
 
266 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  51.29 
 
 
266 aa  224  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  50.86 
 
 
266 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  50 
 
 
240 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  52.59 
 
 
228 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  50.43 
 
 
252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  47.64 
 
 
242 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  52.34 
 
 
245 aa  218  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  53.96 
 
 
235 aa  218  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  46.12 
 
 
240 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  50.43 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  48.95 
 
 
242 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  41.3 
 
 
232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  43.97 
 
 
248 aa  164  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  55.7 
 
 
149 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  44.02 
 
 
233 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  44.68 
 
 
233 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  43.04 
 
 
233 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  37.56 
 
 
263 aa  140  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  34.35 
 
 
227 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  32.78 
 
 
230 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  28.88 
 
 
234 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  28.45 
 
 
234 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  26.61 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  57.14 
 
 
99 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  31.22 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  24.63 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  26.05 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  26.07 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  36.36 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  41.96 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  25.32 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  34.23 
 
 
223 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  21.74 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  31.9 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  24.46 
 
 
222 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  24.46 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  24.46 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  26.24 
 
 
266 aa  58.5  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  27.51 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  24.03 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.71 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  35.11 
 
 
260 aa  56.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  26.74 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  24.03 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  24.75 
 
 
247 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  24.79 
 
 
198 aa  55.1  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  29.69 
 
 
237 aa  55.1  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  28.05 
 
 
226 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  28.07 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  27.91 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  27.91 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.34 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.34 
 
 
297 aa  52.4  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  31.9 
 
 
222 aa  52.4  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  20.92 
 
 
231 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  24.29 
 
 
234 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.89 
 
 
224 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  25.53 
 
 
230 aa  52  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  26.75 
 
 
232 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  26.75 
 
 
232 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  25.89 
 
 
246 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  26.75 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  31.3 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  27 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  29.33 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  22.32 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  30.4 
 
 
231 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  25.6 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  25.22 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  30.26 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>