127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02852 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  57.46 
 
 		 790 aa  954    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  58.59 
 
 		 781 aa  970    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 808 aa  1653    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  43 
 
 		 762 aa  625  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  40.56 
 
 		 792 aa  541  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 792 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 791 aa  180  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 747 aa  163  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 765 aa  164  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 768 aa  153  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 777 aa  147  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  21.62 
 
 		 753 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 780 aa  122  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 738 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 738 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 766 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 768 aa  101  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 799 aa  98.2  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  21.82 
 
 		 814 aa  94.4  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  24.71 
 
 		 768 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 796 aa  88.6  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 782 aa  87.8  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 729 aa  82  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 835 aa  75.5  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 786 aa  73.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 777 aa  72.8  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 772 aa  68.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 746 aa  65.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 721 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 794 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.78 
 
 		 766 aa  62  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  21.29 
 
 		 786 aa  61.2  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  25.81 
 
 		 760 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 		 797 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 820 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 721 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 828 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 828 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  21.27 
 
 		 696 aa  59.7  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 747 aa  60.1  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  23.59 
 
 		 778 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  24.48 
 
 		 828 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  28.07 
 
 		 760 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 828 aa  58.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  21.25 
 
 		 736 aa  58.2  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  24.14 
 
 		 809 aa  57.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  24.14 
 
 		 809 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  24.14 
 
 		 809 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 815 aa  57.4  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 798 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 736 aa  56.6  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3044  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 821 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000527887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  23.33 
 
 		 809 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 790 aa  55.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  21.79 
 
 		 705 aa  55.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1315  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 821 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000529097  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1306  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 820 aa  55.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 720 aa  55.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1342  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 820 aa  54.7  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00424571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  29.56 
 
 		 623 aa  54.3  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 		 713 aa  53.5  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 708 aa  52.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 841 aa  52.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  21.89 
 
 		 711 aa  52.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 833 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1237  TonB-dependent receptor, plug  29.85 
 
 		 814 aa  52  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 705 aa  51.2  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 802 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 781 aa  51.2  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1482  TonB-dependent receptor, putative  26.54 
 
 		 815 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2846  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 823 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000571125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2944  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 823 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000178601  normal  0.742035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 708 aa  50.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  23.46 
 
 		 721 aa  50.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 708 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  36.05 
 
 		 746 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  27.68 
 
 		 795 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 		 714 aa  50.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  28.8 
 
 		 729 aa  49.3  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 		 724 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 641 aa  48.5  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  20.68 
 
 		 735 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  22.62 
 
 		 699 aa  48.5  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 719 aa  48.1  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2768  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 823 aa  47.8  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000855789  normal  0.291776 
 
 
-
 
NC_002950  PG1899  TonB-dependent receptor, putative  22.95 
 
 		 794 aa  47  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 750 aa  47.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  34.74 
 
 		 653 aa  47.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 715 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  25.62 
 
 		 776 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.23 
 
 		 727 aa  47.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  20.55 
 
 		 810 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  23.45 
 
 		 724 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  24.15 
 
 		 759 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  20.54 
 
 		 726 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 723 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0705  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 799 aa  46.6  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000765865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 739 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  22.4 
 
 		 789 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  21.54 
 
 		 705 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>