114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2865 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  100 
 
 		 370 aa  764    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  94.59 
 
 		 370 aa  725    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  66.76 
 
 		 359 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  54.14 
 
 		 389 aa  345  8e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  50.28 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  45.3 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  43.6 
 
 		 367 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  39 
 
 		 344 aa  232  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  41.96 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  41.25 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  39.27 
 
 		 344 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  35.29 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  32.65 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  35.85 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  30.64 
 
 		 357 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  36.69 
 
 		 250 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  36.3 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  31.88 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  36.93 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  32.8 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  30.34 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  28.66 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  30.55 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  30.55 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  32.02 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  28.96 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  28.78 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  28.52 
 
 		 348 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  28.23 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  27.63 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  27.14 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  27.96 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  30.22 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  28.01 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  27.82 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  29.73 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  26.09 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  30.77 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  33.77 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  36.94 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  24.04 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  36.94 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  28.03 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  25 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  25 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  23.24 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0910  putative integrase  39.78 
 
 		 95 aa  58.2  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.690439  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0755  putative tyrosine recombinase  37.11 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313446  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  23 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  25.98 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  22.22 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  24.81 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  26.47 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  29.44 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  29.44 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  29.44 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  35.59 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  26.47 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  26.47 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  25.74 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  24.52 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  25.09 
 
 		 397 aa  50.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  26.47 
 
 		 359 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0753  tyrosine recombinase XerD subunit  24.55 
 
 		 297 aa  49.7  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000038176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  27.35 
 
 		 342 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  26.03 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.24 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  23.39 
 
 		 302 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  22.67 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1588  putative phage integrase/recombinase  50.88 
 
 		 66 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.497488  normal  0.399136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21.76 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  27.07 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  25.52 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  25 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  24.27 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  27.54 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  25.7 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.14 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  28.82 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  29.11 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  26.39 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  24.88 
 
 		 298 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  24.44 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3692  integrase family protein  33.33 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.44 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  23.72 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  24.16 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  25.51 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  25.51 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4535  integrase family protein  25.82 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  25.36 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  24.38 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  25.94 
 
 		 419 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  22.55 
 
 		 338 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  26.24 
 
 		 308 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  24.44 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  23.89 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>