80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2815 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  100 
 
 
802 aa  1584    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  54.11 
 
 
807 aa  838    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  43.39 
 
 
715 aa  473  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  44.22 
 
 
536 aa  350  7e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  33.87 
 
 
641 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  29.61 
 
 
647 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  33.94 
 
 
644 aa  295  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  29.2 
 
 
716 aa  275  3e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  32.39 
 
 
652 aa  272  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  28.32 
 
 
660 aa  240  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  26.8 
 
 
625 aa  209  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  27.88 
 
 
697 aa  198  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  26.79 
 
 
684 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  27.71 
 
 
680 aa  177  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  26.29 
 
 
678 aa  170  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  26.64 
 
 
679 aa  165  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  26.61 
 
 
610 aa  164  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  24.36 
 
 
601 aa  162  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  24.17 
 
 
625 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  31.4 
 
 
349 aa  140  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  30.98 
 
 
349 aa  140  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  29.11 
 
 
329 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  32.11 
 
 
328 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  33.33 
 
 
307 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  29.71 
 
 
290 aa  116  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  32.21 
 
 
306 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  29.86 
 
 
296 aa  107  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  29.95 
 
 
224 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  25.36 
 
 
332 aa  94.7  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  24.08 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  27.89 
 
 
300 aa  77  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1951  hypothetical protein  38.18 
 
 
974 aa  71.2  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0884  hypothetical protein  40.74 
 
 
1578 aa  69.7  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0424461  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  21.76 
 
 
578 aa  68.2  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  23.91 
 
 
574 aa  65.1  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  29 
 
 
307 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4788  hypothetical protein  34 
 
 
855 aa  62  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2088  hypothetical protein  30.89 
 
 
183 aa  61.6  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0052  hypothetical protein  37.58 
 
 
377 aa  61.2  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  29.81 
 
 
313 aa  59.7  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  26.2 
 
 
284 aa  58.9  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  22.32 
 
 
295 aa  58.2  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5172  hypothetical protein  37.27 
 
 
735 aa  57  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  27.66 
 
 
320 aa  57.4  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  30.43 
 
 
317 aa  57.4  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1511  hypothetical protein  42.17 
 
 
676 aa  56.6  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0798411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  19.96 
 
 
551 aa  55.8  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  35.64 
 
 
1374 aa  55.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  27.7 
 
 
320 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  28.47 
 
 
293 aa  52.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0854  type II secretion system protein  24.64 
 
 
261 aa  51.6  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.243873  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  26.49 
 
 
558 aa  51.6  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  26.49 
 
 
558 aa  51.6  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  30 
 
 
288 aa  51.2  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  25.5 
 
 
581 aa  51.2  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  26.49 
 
 
558 aa  50.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  25.83 
 
 
558 aa  50.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.66 
 
 
643 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  22.27 
 
 
615 aa  49.7  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  26.17 
 
 
311 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  28.95 
 
 
311 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  24.36 
 
 
577 aa  48.9  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  26.47 
 
 
301 aa  48.9  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  28.14 
 
 
323 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  24.14 
 
 
554 aa  48.1  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  29.85 
 
 
335 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  20.63 
 
 
604 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  24.24 
 
 
314 aa  47.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0195  Type II secretion system F domain protein  23.53 
 
 
616 aa  47  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  26.09 
 
 
311 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  29.17 
 
 
273 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  21.94 
 
 
558 aa  46.2  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4277  Malate/L-lactate dehydrogenase  27.88 
 
 
361 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  26.71 
 
 
292 aa  44.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  24.26 
 
 
313 aa  45.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  24.65 
 
 
318 aa  44.3  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  21.83 
 
 
590 aa  44.7  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  24.82 
 
 
310 aa  44.3  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  23.65 
 
 
316 aa  44.3  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  25.9 
 
 
287 aa  44.3  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>