14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1511 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1511  hypothetical protein  100 
 
 
676 aa  1305    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0798411 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5172  hypothetical protein  54.14 
 
 
735 aa  134  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3003  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like  57.27 
 
 
694 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2088  hypothetical protein  40.44 
 
 
183 aa  91.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4788  hypothetical protein  38.51 
 
 
855 aa  89.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1951  hypothetical protein  48.72 
 
 
974 aa  85.1  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0052  hypothetical protein  40 
 
 
377 aa  84.7  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0884  hypothetical protein  31.7 
 
 
1578 aa  84  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0424461  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  29.37 
 
 
1374 aa  79  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1869  hypothetical protein  34.9 
 
 
421 aa  70.9  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  40.45 
 
 
807 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  42.17 
 
 
802 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2920  hypothetical protein  34.31 
 
 
136 aa  55.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000191516  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1886  hypothetical protein  34.31 
 
 
136 aa  53.9  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>