14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2920 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2920  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  268  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000191516  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1886  hypothetical protein  99.26 
 
 
136 aa  266  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1096  hypothetical protein  33.67 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1951  hypothetical protein  38.37 
 
 
974 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1511  hypothetical protein  34.31 
 
 
676 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0798411 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0904  hypothetical protein  34 
 
 
195 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520582  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  29.01 
 
 
807 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4788  hypothetical protein  30.58 
 
 
855 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  38.1 
 
 
778 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002965  hypothetical protein  34 
 
 
140 aa  52  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2088  hypothetical protein  31.19 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  31 
 
 
1374 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5172  hypothetical protein  37.5 
 
 
735 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  28.68 
 
 
802 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>