15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4788 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4788  hypothetical protein  100 
 
 
855 aa  1696    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1511  hypothetical protein  39.08 
 
 
676 aa  106  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0798411 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1951  hypothetical protein  42.37 
 
 
974 aa  84.3  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5172  hypothetical protein  46.85 
 
 
735 aa  82.8  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  42.06 
 
 
1374 aa  79  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2088  hypothetical protein  31.62 
 
 
183 aa  70.1  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0884  hypothetical protein  40.86 
 
 
1578 aa  66.6  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0424461  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  37.36 
 
 
807 aa  63.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0052  hypothetical protein  36.67 
 
 
377 aa  61.2  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  34 
 
 
802 aa  61.2  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3003  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like  45.56 
 
 
694 aa  55.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2920  hypothetical protein  31.36 
 
 
136 aa  52.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000191516  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1886  hypothetical protein  32.65 
 
 
136 aa  51.6  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0904  hypothetical protein  32.76 
 
 
195 aa  45.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.520582  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  31.3 
 
 
778 aa  44.7  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>