20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5172 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5172  hypothetical protein  100 
 
 
735 aa  1365    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1511  hypothetical protein  54.14 
 
 
676 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0798411 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3003  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like  64.29 
 
 
694 aa  120  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  40.88 
 
 
1374 aa  98.6  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0884  hypothetical protein  43.61 
 
 
1578 aa  95.5  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0424461  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2088  hypothetical protein  43.26 
 
 
183 aa  92.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4788  hypothetical protein  46.85 
 
 
855 aa  83.2  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1951  hypothetical protein  46.61 
 
 
974 aa  82.8  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0052  hypothetical protein  42.72 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1869  hypothetical protein  46.94 
 
 
421 aa  74.3  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  43.53 
 
 
1710 aa  59.7  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.54 
 
 
1489 aa  59.7  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  35.56 
 
 
807 aa  57  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  37.27 
 
 
802 aa  55.8  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  40.23 
 
 
1088 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2087  CHRD domain containing protein  36.11 
 
 
729 aa  48.1  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.090076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2920  hypothetical protein  37.5 
 
 
136 aa  45.8  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000191516  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1886  hypothetical protein  37.5 
 
 
136 aa  45.8  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  52.24 
 
 
355 aa  45.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  30 
 
 
605 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>