16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0052 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0052  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  723    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1869  hypothetical protein  54.5 
 
 
421 aa  366  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2734  hypothetical protein  51.28 
 
 
1374 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0884  hypothetical protein  45.22 
 
 
1578 aa  76.3  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0424461  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5172  hypothetical protein  43.88 
 
 
735 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1511  hypothetical protein  42.74 
 
 
676 aa  74.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0798411 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2088  hypothetical protein  38.64 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3003  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like  41.27 
 
 
694 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  38.79 
 
 
807 aa  64.7  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4788  hypothetical protein  37.38 
 
 
855 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  37.58 
 
 
802 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1951  hypothetical protein  34.78 
 
 
974 aa  60.1  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2471  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.31 
 
 
1489 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3508  hypothetical protein  37.04 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2087  CHRD domain containing protein  29.37 
 
 
729 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.090076 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  35.29 
 
 
1710 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>