167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0968 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  100 
 
 		 122 aa  234  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  58.2 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1302  UspA domain protein  48.36 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  47.54 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3430  UspA domain protein  46.72 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  36.17 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  30.95 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  45.83 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  34.88 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.3 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  31.16 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  26.09 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  29.29 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  41.67 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  40.91 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  30.84 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  27.01 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  41.18 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  40.85 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.71 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  43.84 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  40 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.41 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  36 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  41.43 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  32.22 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.66 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  42.25 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  41.41 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  44.93 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.34 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  40.28 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  40 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  28.47 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  32.35 
 
 		 286 aa  50.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  27.61 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.82 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  39.68 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  29.55 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  29.77 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  28.06 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.35 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.03 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  41.27 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.85 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  28.68 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  29.79 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  34.09 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  39.62 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  40.58 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  44.9 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  30.22 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  33.33 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  27.2 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  26.95 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  20.83 
 
 		 278 aa  47.4  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  27.46 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  30.99 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  28.99 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  30.6 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.34 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  42.47 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  24.82 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  29.76 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  32.22 
 
 		 296 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  35.44 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  24.09 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  39.68 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  29.1 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  29.08 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  30.56 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  30.56 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  32.93 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  26.24 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.64 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  31.58 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.66 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  28.23 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.17 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  26.56 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  36.36 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  30.99 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  31.47 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  33.33 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  34.62 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  39.62 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>