184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3004 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  68.95 
 
 		 541 aa  748    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  100 
 
 		 551 aa  1116    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  34.77 
 
 		 558 aa  277  4e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  29.82 
 
 		 490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  29.78 
 
 		 502 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  29.72 
 
 		 607 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  28.01 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  27.67 
 
 		 510 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  29.03 
 
 		 514 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  29.03 
 
 		 514 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  29.03 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  28.63 
 
 		 514 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  29.39 
 
 		 514 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  26.5 
 
 		 517 aa  136  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  27.09 
 
 		 544 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  28.98 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  26.78 
 
 		 533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  26.62 
 
 		 548 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  28.05 
 
 		 517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  27.76 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  28.6 
 
 		 524 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  26.61 
 
 		 516 aa  114  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  27.13 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  26.54 
 
 		 471 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  26.08 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  39.44 
 
 		 248 aa  103  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  28.16 
 
 		 311 aa  99  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  34.39 
 
 		 203 aa  95.1  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  29.56 
 
 		 475 aa  93.2  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  33.52 
 
 		 220 aa  91.3  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  24.49 
 
 		 835 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  30.77 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  33.99 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  28.19 
 
 		 551 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  30 
 
 		 974 aa  78.6  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  25.23 
 
 		 836 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  23.77 
 
 		 1078 aa  77.4  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1079 aa  77  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  23.72 
 
 		 1078 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  22.97 
 
 		 1017 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  25.6 
 
 		 749 aa  75.1  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  34.76 
 
 		 284 aa  73.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  28.5 
 
 		 284 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  29.17 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  25.97 
 
 		 307 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  26.7 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  23.82 
 
 		 837 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  26.74 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  23.87 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  28.65 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0866  Spermine synthase  28.53 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  24.76 
 
 		 510 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  27.72 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  27.4 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  27.89 
 
 		 520 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  26.11 
 
 		 248 aa  62  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  27.89 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  31.69 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  27.89 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  27.89 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  29.14 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3304  spermidine synthase  22.49 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0560723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2430  spermine synthase  22.82 
 
 		 704 aa  60.1  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  27.1 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  26.28 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  27.53 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3461  spermidine synthase  23.23 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  23.18 
 
 		 982 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  26.96 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  29.33 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  26.09 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  26.25 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  26.54 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2880  spermidine synthase  23.62 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.548533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  25.37 
 
 		 536 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  28.19 
 
 		 315 aa  57  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  25.71 
 
 		 304 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  26.44 
 
 		 844 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0905  Spermine synthase  21.58 
 
 		 805 aa  56.6  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0140843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  26.88 
 
 		 271 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  27.05 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  26.96 
 
 		 271 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  23.91 
 
 		 529 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  26.79 
 
 		 262 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  26.82 
 
 		 283 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  25.6 
 
 		 681 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3735  spermidine synthase  26.43 
 
 		 499 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  26.61 
 
 		 339 aa  54.7  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  26.25 
 
 		 274 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  25.64 
 
 		 281 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  26.86 
 
 		 268 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  31.94 
 
 		 280 aa  54.3  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  22.46 
 
 		 782 aa  53.9  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  28.29 
 
 		 278 aa  53.9  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  26.4 
 
 		 273 aa  53.9  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  24.52 
 
 		 991 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  25.29 
 
 		 289 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  32.64 
 
 		 280 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  32.64 
 
 		 280 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>