More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6345 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 241 aa  490  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 242 aa  72  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 213 aa  72  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  29.58 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  23.79 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 194 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 196 aa  62  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  32.84 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>