236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5977 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  100 
 
 		 447 aa  888    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  35.8 
 
 		 462 aa  203  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  36.67 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  35.05 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2921  LmbE family protein  44.34 
 
 		 264 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  34.61 
 
 		 502 aa  180  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  36.63 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3594  LmbE family protein  44.39 
 
 		 246 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4099  LmbE-like protein  41.47 
 
 		 246 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.149754  normal  0.14336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  33.18 
 
 		 427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0797  LmbE family protein  42.47 
 
 		 244 aa  150  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34049  normal  0.5646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1388  LmbE family protein  40.73 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1227  LmbE family protein  40.53 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0576  LmbE-like protein  37.6 
 
 		 261 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3660  LmbE family protein  43.06 
 
 		 245 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1164  LmbE family protein  39.52 
 
 		 245 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  40.84 
 
 		 195 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  33.64 
 
 		 708 aa  133  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  32.88 
 
 		 260 aa  132  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  44 
 
 		 192 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  33.79 
 
 		 265 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  40.96 
 
 		 198 aa  123  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  40.43 
 
 		 198 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  41.21 
 
 		 208 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  41.38 
 
 		 192 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  40 
 
 		 208 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  40.32 
 
 		 191 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  34.95 
 
 		 197 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2160  LmbE family protein  40 
 
 		 292 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  38.55 
 
 		 199 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4938  NodS  36.72 
 
 		 203 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  39.1 
 
 		 199 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  39.1 
 
 		 199 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  38.12 
 
 		 201 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  40.14 
 
 		 199 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  38.12 
 
 		 201 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  34.03 
 
 		 240 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  37.42 
 
 		 199 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  40.97 
 
 		 192 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  41.18 
 
 		 197 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  39.26 
 
 		 302 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  34.44 
 
 		 197 aa  100  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  37.67 
 
 		 199 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  36.31 
 
 		 202 aa  97.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  39.47 
 
 		 277 aa  90.5  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  30.45 
 
 		 193 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2999  LmbE-like protein  37.13 
 
 		 257 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4069  LmbE-like protein  34.05 
 
 		 260 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.64995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2542  LmbE-like protein  34.89 
 
 		 252 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  31.05 
 
 		 207 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2637  LmbE family protein  35.42 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338459  normal  0.600261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3132  hypothetical protein  34.12 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  27.75 
 
 		 265 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  32.23 
 
 		 322 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2653  LmbE family protein  35.9 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327123  normal  0.817849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5872  LmbE family protein  31.72 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359965 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  28.5 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  29.8 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3258  LmbE family protein  33.48 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1304  LmbE family protein  27.06 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.528408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2445  hypothetical protein  29.95 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.122432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2503  LmbE family protein  33.04 
 
 		 251 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  36.64 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  28.51 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  36.22 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  29.03 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  36.05 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  37.21 
 
 		 228 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  27.36 
 
 		 265 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  34.03 
 
 		 1001 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0312  LmbE family protein  22.35 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  29.28 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 1015 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10890  uncharacterized LmbE-like protein  31.33 
 
 		 234 aa  62.4  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0375606  normal  0.400819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2740  LmbE family protein  31.02 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  31.65 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2463  LmbE family protein  31.51 
 
 		 259 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204581 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1160  LmbE family protein  31.37 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  33.66 
 
 		 240 aa  59.7  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  31.14 
 
 		 190 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  28.3 
 
 		 237 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  28.5 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  27.96 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  30.41 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  23.08 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  28.31 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  34.65 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2850  LmbE family protein  23.04 
 
 		 225 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  26.53 
 
 		 693 aa  56.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2086  LmbE-like protein  32.41 
 
 		 262 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2223  LmbE-like protein  24.87 
 
 		 227 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  28.64 
 
 		 227 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  29.44 
 
 		 227 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  32.82 
 
 		 222 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1118  hypothetical protein  30.57 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.31 
 
 		 233 aa  55.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1431  LmbE family protein  35.48 
 
 		 124 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  29 
 
 		 308 aa  54.3  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  41.25 
 
 		 189 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  41.25 
 
 		 189 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>