More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3173 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3173  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 		 453 aa  874    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12818  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1340  preprotein translocase subunit SecF  53.25 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.265736  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3823  protein-export membrane protein SecF  44.71 
 
 		 416 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344735  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1813  protein-export membrane protein SecF  50.58 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2584  preprotein translocase subunit SecF  43.7 
 
 		 423 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173731  normal  0.904597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1803  protein-export membrane protein SecF  46.38 
 
 		 394 aa  312  9e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162985  decreased coverage  0.00000393416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3390  protein-export membrane protein SecF  45.15 
 
 		 432 aa  307  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000120226  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12606  preprotein translocase subunit SecF  42.79 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2316  preprotein translocase subunit SecF  41.58 
 
 		 417 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.658853  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2277  preprotein translocase subunit SecF  41.58 
 
 		 417 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2324  preprotein translocase subunit SecF  41.58 
 
 		 417 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223224  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3815  preprotein translocase subunit SecF  47.92 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130348  normal  0.401094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1696  protein-export membrane protein SecF  48.84 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467956  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2305  protein-export membrane protein SecF  46.37 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.879944  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1374  preprotein translocase subunit SecF  44.76 
 
 		 398 aa  285  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5141  preprotein translocase subunit SecF  49.2 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358124  hitchhiker  0.00205157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6108  preprotein translocase subunit SecF  45.63 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359416  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15110  protein translocase subunit secF  49.57 
 
 		 414 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1365  protein-export membrane protein SecF  45.99 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17560  protein translocase subunit secF  51.53 
 
 		 371 aa  280  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2390  protein translocase subunit secF  46.58 
 
 		 412 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2114  protein-export membrane protein SecF  44.24 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2357  protein-export membrane protein SecF  47.15 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1997  protein-export membrane protein SecF  47.71 
 
 		 358 aa  270  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498449  normal  0.0822875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1799  protein-export membrane protein SecF  47.34 
 
 		 360 aa  262  8e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.544061  normal  0.135983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3050  protein-export membrane protein SecF  47.1 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2060  protein-export membrane protein SecF  49.53 
 
 		 326 aa  256  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2028  preprotein translocase subunit SecF  44.07 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000424362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15300  protein translocase subunit secF  44.87 
 
 		 406 aa  249  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2298  preprotein translocase subunit SecF  43.79 
 
 		 340 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13990  protein translocase subunit secF  42.41 
 
 		 364 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.269244  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0946  protein-export membrane protein SecF  43.2 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1943  protein-export membrane protein SecF  44.51 
 
 		 374 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00503357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1671  protein-export membrane protein SecF  45.1 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12850  protein translocase subunit secF  42.35 
 
 		 346 aa  217  4e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0129827  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  36.52 
 
 		 977 aa  203  5e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  37.54 
 
 		 900 aa  193  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  38.91 
 
 		 855 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  36.39 
 
 		 989 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  36.04 
 
 		 310 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  35.99 
 
 		 296 aa  167  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  31.23 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  37.41 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  34.01 
 
 		 286 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1335  protein translocase subunit secF  38.01 
 
 		 292 aa  151  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  37.78 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  32.53 
 
 		 291 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  33.11 
 
 		 292 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.81 
 
 		 759 aa  150  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  30.77 
 
 		 289 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  32.41 
 
 		 293 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  29.86 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  30.07 
 
 		 289 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  29.31 
 
 		 735 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  33.79 
 
 		 302 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  33.45 
 
 		 302 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  32.41 
 
 		 304 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  33.1 
 
 		 302 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  31.01 
 
 		 308 aa  139  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  32.59 
 
 		 325 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  30.26 
 
 		 307 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  32.39 
 
 		 761 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  31.46 
 
 		 310 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  32.99 
 
 		 302 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  32.64 
 
 		 303 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  31.44 
 
 		 740 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  32.59 
 
 		 307 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  33.76 
 
 		 312 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  32.64 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  30.93 
 
 		 305 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  30.93 
 
 		 305 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  32.44 
 
 		 312 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  36.36 
 
 		 336 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  31.89 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.91 
 
 		 911 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  31.16 
 
 		 302 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.08 
 
 		 762 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  31.01 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  31.86 
 
 		 314 aa  131  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  33.02 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  27.42 
 
 		 302 aa  130  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  30.32 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  33.21 
 
 		 302 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  28.08 
 
 		 310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  32.33 
 
 		 308 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  31.67 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  32.07 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  27.83 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  29.66 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.22 
 
 		 759 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1293  preprotein translocase subunit SecF  32.07 
 
 		 306 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.22 
 
 		 759 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  32.39 
 
 		 311 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2008  preprotein translocase subunit SecF  36.59 
 
 		 313 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  30.84 
 
 		 322 aa  127  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  33.33 
 
 		 291 aa  126  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  30.28 
 
 		 310 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  28.14 
 
 		 337 aa  126  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  27.12 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  31.4 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>