More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0053 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0053  MATE efflux family protein  100 
 
 		 451 aa  882    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.39001  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2355  MATE efflux family protein  74.61 
 
 		 449 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0530772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1862  MATE efflux family protein  75.73 
 
 		 449 aa  654    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0413  MATE efflux family protein  65.38 
 
 		 449 aa  556  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2418  MATE efflux family protein  33.78 
 
 		 471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  34.07 
 
 		 469 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3111  MATE efflux family protein  33.48 
 
 		 489 aa  194  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00116438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2664  MATE efflux family protein  30.87 
 
 		 460 aa  179  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0494  MATE efflux family protein  29.4 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1967  MATE efflux family protein  28.15 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0778152  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0252  MATE efflux family protein  32.22 
 
 		 460 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  28.98 
 
 		 451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  29.24 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  30.08 
 
 		 460 aa  110  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  28.86 
 
 		 467 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  28.36 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  27.92 
 
 		 465 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  30.1 
 
 		 461 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  31.27 
 
 		 468 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  27.95 
 
 		 458 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.13 
 
 		 438 aa  94.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  22.84 
 
 		 445 aa  94.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  29.46 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  25.37 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 456 aa  91.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 470 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 461 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1279  putative inner membrane transmembrane protein  28.31 
 
 		 459 aa  89.7  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0284384  normal  0.285043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  27.34 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0953  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 450 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  29.23 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  29.03 
 
 		 467 aa  87.8  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  25.33 
 
 		 471 aa  87.4  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 469 aa  86.7  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  30.13 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_002950  PG1117  MATE efflux family protein  26.95 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.860788 
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  25.33 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  25.58 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  28 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  25.06 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  27.06 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  25.8 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  25.66 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  26.76 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  24.43 
 
 		 479 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  23.53 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  23.59 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3253  MATE efflux family protein  28.43 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  23.33 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  25.45 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  26.06 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  26.24 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  27.86 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  25.45 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  29.08 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  26.33 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  26.7 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.26 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  30.3 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  27.46 
 
 		 462 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  27.97 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  26.7 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  27.2 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  29.63 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  30.02 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  27.46 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2122  multi anti extrusion protein MatE  26.08 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000217461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  29.08 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  23.82 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  23.7 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1115  MATE efflux family protein  28.57 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000487521  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.31 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3760  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  28.97 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  28.97 
 
 		 469 aa  76.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  26.84 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  27.97 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  27.97 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  27.97 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  27.97 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  27.97 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  27.27 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  25.32 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  28.57 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  25.94 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>