More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3393 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 426 aa  833    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  64.43 
 
 		 376 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  61.13 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  61.97 
 
 		 376 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  61.97 
 
 		 376 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3110  protein of unknown function UPF0118  56.84 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3823  protein of unknown function UPF0118  50 
 
 		 390 aa  309  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0609806  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  44.42 
 
 		 476 aa  292  7e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2128  protein of unknown function UPF0118  49.58 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.813628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  42.82 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  43.84 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  35.85 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  37.43 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  34.77 
 
 		 455 aa  189  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  32.36 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  33.23 
 
 		 464 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  37.19 
 
 		 397 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  33.24 
 
 		 381 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  33.24 
 
 		 381 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  33.23 
 
 		 487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  33.24 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  31.58 
 
 		 423 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  33.23 
 
 		 384 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  34.03 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4772  protein of unknown function UPF0118  37.28 
 
 		 475 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  34.27 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  37.13 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  34.02 
 
 		 415 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39490  predicted permease  35.57 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233759  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  32.14 
 
 		 452 aa  166  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0238  hypothetical protein  31.04 
 
 		 421 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1881  hypothetical protein  31.61 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  35.04 
 
 		 367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  32 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  37.31 
 
 		 387 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  37.69 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2803  protein of unknown function UPF0118  34.64 
 
 		 441 aa  156  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168707  normal  0.0979616 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1895  protein of unknown function UPF0118  39.18 
 
 		 483 aa  153  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23100  predicted permease  33.23 
 
 		 477 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.741637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7052  protein of unknown function UPF0118  31.19 
 
 		 402 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  29.17 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  34.34 
 
 		 405 aa  145  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2291  hypothetical protein  28.83 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.370535  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2637  protein of unknown function UPF0118  35.19 
 
 		 421 aa  142  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  36.71 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  31.95 
 
 		 418 aa  136  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6257  protein of unknown function UPF0118  37.19 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.707833  normal  0.194644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4624  protein of unknown function UPF0118  35.47 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6766  permease-like protein  32.09 
 
 		 432 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7599  hypothetical protein  31.88 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  30.72 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  29.18 
 
 		 398 aa  119  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  31.91 
 
 		 354 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  31.4 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1468  protein of unknown function UPF0118  28.03 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.916675  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  27.73 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  23.64 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  30.07 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  29.43 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.25 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  29.11 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.64 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.64 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  25.74 
 
 		 361 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  25.74 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  27.14 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.64 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.53 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.53 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.53 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  25.41 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  26.32 
 
 		 348 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.81 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  26.21 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  26.93 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 392 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  27.17 
 
 		 398 aa  100  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  27.49 
 
 		 436 aa  100  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1841  permease  31.84 
 
 		 563 aa  99.8  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  30.51 
 
 		 436 aa  99.8  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  23.95 
 
 		 455 aa  99  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0708  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  26.3 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26.51 
 
 		 388 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  22.59 
 
 		 529 aa  96.3  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23.4 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.69 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.4 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  25.62 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  27.84 
 
 		 373 aa  94  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  24.23 
 
 		 376 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  27.11 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  23.91 
 
 		 402 aa  92.8  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  23.91 
 
 		 402 aa  92.8  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.96 
 
 		 369 aa  93.2  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  24.93 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  28.8 
 
 		 365 aa  92.8  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.61 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.04 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  25.29 
 
 		 369 aa  92.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>