More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6361 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  32.76 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  44.32 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 403 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  42.67 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 414 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  48.21 
 
 		 262 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 231 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 497 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>