123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5811 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  450  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  53.64 
 
 		 221 aa  214  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  52.47 
 
 		 221 aa  208  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0033  TetR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3333  transcriptional regulator, TetR family  53.77 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0853  regulatory protein TetR  51.38 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3153  transcriptional regulator, TetR family  40.18 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4274  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5659  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2557  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10458  transcriptional regulator  29 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2324  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  36.56 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  38.1 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  31.15 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18430  transcriptional regulator, tetR family  25.83 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.120419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0040  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 424 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  28.37 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28950  Transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 195 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 422 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 179 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 453 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  21.47 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0558  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235529  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  22.77 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2241  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7288  hitchhiker  0.000000000000408452 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  24.51 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  28.77 
 
 		 346 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  21.82 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  33.93 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 219 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 260 aa  42  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>