92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2771 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 		 515 aa  1039    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  61.42 
 
 		 601 aa  492  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  36.86 
 
 		 563 aa  207  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  32.13 
 
 		 621 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  26.72 
 
 		 506 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  32.6 
 
 		 524 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  30.82 
 
 		 647 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  32.37 
 
 		 529 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  29.79 
 
 		 672 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  29.81 
 
 		 624 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  29.43 
 
 		 583 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  33.59 
 
 		 583 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  29.14 
 
 		 472 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  28.46 
 
 		 604 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  29.48 
 
 		 467 aa  113  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  25 
 
 		 438 aa  103  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  29.35 
 
 		 804 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  30 
 
 		 668 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  30.29 
 
 		 379 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  26.12 
 
 		 447 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  27.1 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  29.63 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  25.49 
 
 		 462 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  30.47 
 
 		 647 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  45.31 
 
 		 996 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  39.36 
 
 		 1083 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1074 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  45.31 
 
 		 1030 aa  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  27.1 
 
 		 750 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  24.77 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  28.09 
 
 		 719 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  45.07 
 
 		 1005 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  37.63 
 
 		 1081 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  42.03 
 
 		 1023 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1169 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1012 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 1152 aa  47.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  24.58 
 
 		 404 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  43.64 
 
 		 1039 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  43.33 
 
 		 1060 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  45.9 
 
 		 1127 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  37.65 
 
 		 1056 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  37.65 
 
 		 1145 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  35.42 
 
 		 1041 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  49.06 
 
 		 1102 aa  47  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  43.64 
 
 		 1034 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 1130 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  38.1 
 
 		 1023 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  48.98 
 
 		 1088 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  37.93 
 
 		 1008 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  43.64 
 
 		 1017 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1163 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  43.64 
 
 		 993 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  35.62 
 
 		 1023 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  24.76 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  39.19 
 
 		 1128 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  44.44 
 
 		 979 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  28.67 
 
 		 629 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  27.97 
 
 		 632 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  28.67 
 
 		 629 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  26.38 
 
 		 728 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  32 
 
 		 858 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  29.59 
 
 		 322 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  40.26 
 
 		 1051 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  43.64 
 
 		 1042 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  39.66 
 
 		 1077 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  36.71 
 
 		 1040 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  21.39 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  25.24 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  39.19 
 
 		 1139 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  43.64 
 
 		 1036 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  38.33 
 
 		 1047 aa  44.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  43.48 
 
 		 1076 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  36.14 
 
 		 1013 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  40.35 
 
 		 1150 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  43.28 
 
 		 1006 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  22.7 
 
 		 754 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  36.49 
 
 		 1014 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 		 1079 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  40.68 
 
 		 1080 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  43.33 
 
 		 1033 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  35.44 
 
 		 1168 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  47.17 
 
 		 1101 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  45.45 
 
 		 1079 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  43.48 
 
 		 1076 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 1205 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  37.14 
 
 		 1041 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1073 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 1093 aa  43.5  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  41.38 
 
 		 1106 aa  43.5  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  25.77 
 
 		 302 aa  43.5  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1049 aa  43.5  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>