147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_A0012 on replicon NC_011351
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011351  ECH74115_A0012  conjugal transfer protein  100 
 
 		 792 aa  1645    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.829213 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08213  conjugal transfer protein TraE  47.36 
 
 		 752 aa  710    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0030  conjugal transfer protein  40.93 
 
 		 841 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  37.66 
 
 		 804 aa  501  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7534  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  34.04 
 
 		 857 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339872  normal  0.0463504 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  28.95 
 
 		 823 aa  334  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  28.42 
 
 		 822 aa  327  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  29.33 
 
 		 821 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.94 
 
 		 826 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.94 
 
 		 826 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  28.73 
 
 		 822 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  27.89 
 
 		 830 aa  321  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.82 
 
 		 826 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  30.32 
 
 		 793 aa  313  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.34 
 
 		 805 aa  308  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.75 
 
 		 796 aa  303  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  29.01 
 
 		 815 aa  302  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  28.43 
 
 		 790 aa  301  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.73 
 
 		 829 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.77 
 
 		 830 aa  295  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  27.33 
 
 		 835 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  27.5 
 
 		 788 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  27.04 
 
 		 831 aa  274  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1137  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  26.64 
 
 		 816 aa  274  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  26.92 
 
 		 831 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  27.01 
 
 		 785 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0102  pilx4 protein  28.49 
 
 		 876 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.894843 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  28.45 
 
 		 803 aa  258  3e-67  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0037  triC protein  25.79 
 
 		 915 aa  249  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  26.7 
 
 		 801 aa  239  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  25.93 
 
 		 800 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  26.64 
 
 		 924 aa  235  3e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  25.3 
 
 		 789 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  25.73 
 
 		 803 aa  233  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  25.81 
 
 		 800 aa  232  2e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  23.83 
 
 		 797 aa  227  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  24.51 
 
 		 789 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1487  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  28.31 
 
 		 915 aa  223  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.18 
 
 		 804 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  24.61 
 
 		 839 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.02 
 
 		 805 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0108  TriC protein  24.4 
 
 		 916 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.22 
 
 		 819 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  26.17 
 
 		 922 aa  211  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7347  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  23.99 
 
 		 849 aa  208  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.327754 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  24.43 
 
 		 826 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  24.16 
 
 		 819 aa  198  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  24.37 
 
 		 826 aa  197  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0180  cmgb3/4  27.84 
 
 		 561 aa  167  5e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  26.05 
 
 		 791 aa  146  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.72 
 
 		 787 aa  144  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  25.68 
 
 		 791 aa  143  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  21.58 
 
 		 788 aa  130  8.000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9656  conjugal transfer protein TrbE  21.85 
 
 		 687 aa  97.4  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03001  hypothetical protein  34.39 
 
 		 169 aa  97.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2030  conjugal transfer ATPase TrbE  23.42 
 
 		 813 aa  93.2  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1717  conjugal transfer ATPase TrbE  22.62 
 
 		 819 aa  90.5  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.137188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6505  conjugal transfer protein TrbE  21.62 
 
 		 852 aa  89.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158384  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  21.34 
 
 		 791 aa  89.7  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6632  conjugal transfer protein TrbE  21.62 
 
 		 852 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4271  conjugal transfer protein TrbE  21.45 
 
 		 852 aa  88.6  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000528773  normal  0.467859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0164  conjugal transfer ATPase TrbE  22.12 
 
 		 822 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.627498  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0153  conjugal transfer ATPase TrbE  23.45 
 
 		 872 aa  84.7  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1191  conjugal transfer ATPase TrbE  22.37 
 
 		 816 aa  84.3  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3544  conjugal transfer ATPase TrbE  22.37 
 
 		 816 aa  84.3  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4198  conjugal transfer ATPase TrbE  23.18 
 
 		 813 aa  84  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330213  normal  0.981224 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2349  conjugal transfer ATPase TrbE  22 
 
 		 820 aa  83.2  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2581  conjugal transfer ATPase TrbE  24.1 
 
 		 816 aa  82  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  21.78 
 
 		 819 aa  82  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3703  conjugal transfer ATPase TrbE  23.1 
 
 		 817 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165131  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2696  conjugal transfer ATPase TrbE  23.17 
 
 		 823 aa  81.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0851108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35690  conjugal transfer ATPase TrbE  23.96 
 
 		 816 aa  81.3  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7744  conjugal transfer ATPase TrbE  22.21 
 
 		 812 aa  81.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3503  conjugal transfer ATPase TrbE  22.93 
 
 		 823 aa  80.9  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.584656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1553  conjugal transfer ATPase TrbE  22.68 
 
 		 809 aa  80.1  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2007  conjugal transfer ATPase TrbE  24.55 
 
 		 816 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1503  conjugal transfer ATPase TrbE  23.01 
 
 		 813 aa  80.5  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373275  normal  0.784639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1838  conjugal transfer ATPase TrbE  22.05 
 
 		 808 aa  80.9  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2881  conjugal transfer ATPase TrbE  23 
 
 		 812 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244722  normal  0.034415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2353  conjugal transfer ATPase TrbE  24.32 
 
 		 816 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.344124 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5372  conjugal transfer ATPase TrbE  24.69 
 
 		 824 aa  80.5  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.259729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2348  conjugal transfer ATPase TrbE  24.78 
 
 		 810 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1898  conjugal transfer ATPase TrbE  23.34 
 
 		 817 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0435  conjugal transfer ATPase TrbE  23.15 
 
 		 817 aa  79.7  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1285  conjugal transfer ATPase TrbE  23.65 
 
 		 816 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3367  conjugal transfer ATPase TrbE  22.38 
 
 		 814 aa  78.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0884  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  24.11 
 
 		 843 aa  78.6  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5485  conjugal transfer protein TrbE  23.91 
 
 		 815 aa  78.2  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00798845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2648  conjugal transfer ATPase TrbE  22.5 
 
 		 825 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.947837  normal  0.965174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3854  conjugal transfer ATPase TrbE  21.48 
 
 		 830 aa  78.2  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0508748  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  19.64 
 
 		 791 aa  77.8  0.0000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3830  conjugal transfer ATPase TrbE  22.47 
 
 		 818 aa  77.4  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0746  conjugal transfer ATPase TrbE  22.28 
 
 		 812 aa  77.4  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.369643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1344  conjugal transfer ATPase TrbE  21.89 
 
 		 819 aa  76.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2503  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  24.6 
 
 		 814 aa  76.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5379  conjugal transfer protein TrbE  22.22 
 
 		 817 aa  76.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0696  conjugal transfer ATPase TrbE  21.48 
 
 		 847 aa  76.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0729  conjugal transfer ATPase TrbE  23.24 
 
 		 816 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3898  conjugal transfer ATPase TrbE  22.03 
 
 		 813 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2908  conjugal transfer ATPase TrbE  22.68 
 
 		 811 aa  74.3  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>