126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0893 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0893  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0068  cell wall hydrolase/autolysin  43.64 
 
 		 560 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 754 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  41.79 
 
 		 253 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  41.79 
 
 		 256 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  42.59 
 
 		 394 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  50 
 
 		 428 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  48.94 
 
 		 470 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  52.27 
 
 		 788 aa  50.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 590 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  32.05 
 
 		 274 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.64 
 
 		 327 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  38.89 
 
 		 465 aa  48.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 307 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1855  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.86 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.653374  normal  0.622298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.62 
 
 		 1001 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  47.92 
 
 		 212 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  46.51 
 
 		 330 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  45.1 
 
 		 310 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0920  spore coat assembly protein SafA  47.83 
 
 		 538 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  38 
 
 		 1021 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  47.83 
 
 		 428 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  41.3 
 
 		 617 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1754  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  48.72 
 
 		 448 aa  47  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0659855  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  33.59 
 
 		 287 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  36 
 
 		 318 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  41.46 
 
 		 264 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  35.63 
 
 		 253 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04252  LysM domain protein  40 
 
 		 424 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.75 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  45 
 
 		 271 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.76 
 
 		 593 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  44.68 
 
 		 526 aa  45.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 422 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  30.85 
 
 		 751 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  32.23 
 
 		 307 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 500 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.38 
 
 		 954 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 1079 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  40.82 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 		 368 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.08 
 
 		 631 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  43.14 
 
 		 419 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0050  Peptidoglycan-binding LysM  42.22 
 
 		 507 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  41.67 
 
 		 333 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.96 
 
 		 637 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  32.05 
 
 		 286 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4163  hypothetical protein  38.89 
 
 		 556 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.868125  normal  0.304031 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  48.72 
 
 		 429 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  42.86 
 
 		 301 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 733 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  46.67 
 
 		 299 aa  42.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  42 
 
 		 372 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  42 
 
 		 372 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0657  Peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 266 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  43.48 
 
 		 432 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  35.09 
 
 		 246 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  38.89 
 
 		 257 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  36.73 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1191  regulatory protein dnir  45.45 
 
 		 404 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  34 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  47.92 
 
 		 301 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  39.58 
 
 		 390 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  32.84 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  38.64 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.89 
 
 		 576 aa  42  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4963  peptidoglycan-binding LysM  30.26 
 
 		 380 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.867782  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4268  peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000954581  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  44.44 
 
 		 1556 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  46 
 
 		 430 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  41.3 
 
 		 727 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.81 
 
 		 270 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  41.86 
 
 		 390 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  42.86 
 
 		 296 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  39.58 
 
 		 423 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 414 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  34.57 
 
 		 403 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  40.82 
 
 		 292 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 142 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  41.3 
 
 		 727 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38 
 
 		 433 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02660  Peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  32.65 
 
 		 430 aa  41.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  44.68 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  44.68 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 285 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  39.53 
 
 		 274 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  34.25 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  43.14 
 
 		 546 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  42.22 
 
 		 405 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  42.22 
 
 		 453 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  46.15 
 
 		 293 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  50 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>