114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0657 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0657  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 266 aa  531  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  29.94 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  36.22 
 
 		 544 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  35.67 
 
 		 587 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  32.2 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  30 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  30 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  30 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  29.17 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  28.99 
 
 		 849 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 733 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  29.17 
 
 		 515 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  32.8 
 
 		 557 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1839  peptidoglycan-binding LysM  31.45 
 
 		 314 aa  52.4  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.955288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35 
 
 		 840 aa  52.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  26.83 
 
 		 620 aa  52  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  27.35 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.14 
 
 		 530 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  30.71 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  30.08 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  25.97 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  31.45 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  26.62 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  28.33 
 
 		 515 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  29.17 
 
 		 515 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.89 
 
 		 552 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  32.08 
 
 		 546 aa  50.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  27.78 
 
 		 466 aa  49.7  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  26.89 
 
 		 514 aa  49.3  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 		 368 aa  49.3  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  23.89 
 
 		 555 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  30.25 
 
 		 511 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  31.62 
 
 		 542 aa  48.9  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  26.09 
 
 		 173 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  26.62 
 
 		 442 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  25.16 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  29.61 
 
 		 595 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.1 
 
 		 1001 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  27.87 
 
 		 518 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  27.97 
 
 		 1021 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 553 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  32.23 
 
 		 498 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  27.2 
 
 		 524 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.48 
 
 		 470 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  30.16 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  31.25 
 
 		 546 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  27.61 
 
 		 175 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  30.33 
 
 		 389 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.81 
 
 		 515 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.58 
 
 		 593 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.58 
 
 		 631 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.67 
 
 		 637 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  26.67 
 
 		 423 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  28.57 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.73 
 
 		 554 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  26.27 
 
 		 179 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  29.66 
 
 		 476 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  30.63 
 
 		 881 aa  46.2  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0474  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.25 
 
 		 801 aa  46.2  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.51 
 
 		 532 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0890  hypothetical protein  31.78 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.874622  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2753  hypothetical protein  52.17 
 
 		 476 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2626  hypothetical protein  52.17 
 
 		 476 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.13 
 
 		 534 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03621  LysM domain-containing protein  23.9 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.624755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  35.64 
 
 		 498 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30 
 
 		 581 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15830  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  30.63 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103964  normal  0.0951382 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.83 
 
 		 679 aa  44.7  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.19 
 
 		 797 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  26.83 
 
 		 560 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  27.48 
 
 		 522 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  30.4 
 
 		 478 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.64 
 
 		 527 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  25.66 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  29.06 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1862  Peptidoglycan-binding LysM  30.47 
 
 		 642 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.746272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  31.58 
 
 		 347 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  42.55 
 
 		 471 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0569  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.67 
 
 		 471 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  26.32 
 
 		 503 aa  43.9  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  29.46 
 
 		 467 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  28.95 
 
 		 580 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0563  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  42 
 
 		 439 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538528  normal  0.250383 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.71 
 
 		 517 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  25.86 
 
 		 534 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  25.34 
 
 		 452 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  28.75 
 
 		 661 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  30.25 
 
 		 563 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  25.93 
 
 		 495 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0893  Peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 137 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.83 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  25.17 
 
 		 473 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  33.33 
 
 		 465 aa  42.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  30.33 
 
 		 474 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.32 
 
 		 406 aa  42.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.32 
 
 		 406 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2150  LysM domain-containing protein  30.21 
 
 		 501 aa  42.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  29.2 
 
 		 539 aa  42.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  28.3 
 
 		 393 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>