More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3234 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 213 aa  85.5  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3094  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.432559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1265  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  41.77 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  24.14 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  30 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1436  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.940915  normal  0.193535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  24.48 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2288  regulatory protein, TetR  24.36 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  23.08 
 
 		 346 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  21.64 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  21.88 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 218 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  20.51 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4473  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  30.91 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>