183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0605 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 553 aa  1146    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  46.29 
 
 		 552 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 717 aa  262  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.61 
 
 		 529 aa  259  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 717 aa  257  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  37.76 
 
 		 699 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.08 
 
 		 1106 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 627 aa  243  7.999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.98 
 
 		 589 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  30.83 
 
 		 780 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 780 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 779 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.63 
 
 		 589 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 776 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 776 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  31.33 
 
 		 821 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.62 
 
 		 723 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 1714 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  31.33 
 
 		 776 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  31.33 
 
 		 776 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  31.33 
 
 		 776 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  31.33 
 
 		 821 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 1106 aa  224  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.37 
 
 		 739 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 789 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30.48 
 
 		 585 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 713 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  30.51 
 
 		 797 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 		 647 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 633 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.25 
 
 		 715 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.12 
 
 		 739 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.52 
 
 		 739 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 796 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  31.19 
 
 		 781 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.67 
 
 		 667 aa  207  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  26.71 
 
 		 1116 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 968 aa  201  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 828 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 789 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 727 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.42 
 
 		 740 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.08 
 
 		 790 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.75 
 
 		 708 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 740 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  26.25 
 
 		 790 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 734 aa  197  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 828 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 598 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 828 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 619 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.56 
 
 		 742 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 732 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 633 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 693 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 708 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 1143 aa  190  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 824 aa  190  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  31.32 
 
 		 596 aa  190  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  35.9 
 
 		 937 aa  190  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  28.18 
 
 		 1144 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  30.13 
 
 		 921 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 754 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 754 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 595 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  27.91 
 
 		 1415 aa  177  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 		 672 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 833 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  26.86 
 
 		 1221 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 833 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 3035 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 3560 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 626 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1085 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 974 aa  168  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 569 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 822 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 660 aa  162  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 718 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 654 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1094 aa  156  9e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 616 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 733 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  30.54 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  29.35 
 
 		 459 aa  156  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 700 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 4489 aa  150  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 		 667 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 739 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 611 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 761 aa  146  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  28.34 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 732 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 706 aa  145  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  27.54 
 
 		 632 aa  144  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 632 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 647 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 750 aa  140  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 618 aa  140  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>