More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1109 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  100 
 
 		 1075 aa  2221    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  41.49 
 
 		 1112 aa  800    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  40.7 
 
 		 1069 aa  791    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  64.58 
 
 		 1078 aa  1427    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  53.43 
 
 		 1075 aa  1134    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  42.67 
 
 		 1067 aa  868    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  66.27 
 
 		 1075 aa  1485    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  58.06 
 
 		 1077 aa  1263    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  40.51 
 
 		 1065 aa  793    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  41.17 
 
 		 1071 aa  806    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  55.33 
 
 		 1090 aa  1226    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.01 
 
 		 1085 aa  960    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  53.01 
 
 		 1074 aa  1134    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  38.67 
 
 		 1053 aa  674    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  40.36 
 
 		 1077 aa  810    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  54.1 
 
 		 1082 aa  1166    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  41.25 
 
 		 1072 aa  838    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  45.74 
 
 		 1081 aa  920    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  40.44 
 
 		 1077 aa  791    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  55.68 
 
 		 1087 aa  1226    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  39.02 
 
 		 1078 aa  794    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  46.34 
 
 		 1083 aa  971    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  40.29 
 
 		 1064 aa  766    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  52.83 
 
 		 696 aa  731    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1065 aa  687    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  47.81 
 
 		 1089 aa  963    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  27.7 
 
 		 1128 aa  221  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  25.9 
 
 		 1016 aa  220  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  27.45 
 
 		 1131 aa  214  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  27.78 
 
 		 1153 aa  206  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  26.59 
 
 		 1124 aa  205  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  27.04 
 
 		 1109 aa  197  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  27.19 
 
 		 1086 aa  188  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  27.11 
 
 		 1153 aa  189  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  24.71 
 
 		 1143 aa  184  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  26.15 
 
 		 853 aa  181  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  25.66 
 
 		 1100 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  28.66 
 
 		 1140 aa  174  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  26.98 
 
 		 1052 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  26.01 
 
 		 1051 aa  162  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  26.89 
 
 		 1080 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  26.17 
 
 		 1086 aa  160  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.8 
 
 		 1160 aa  142  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  25.27 
 
 		 1086 aa  141  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  24.89 
 
 		 1125 aa  139  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  23.19 
 
 		 1127 aa  139  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  26.91 
 
 		 1099 aa  136  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  26.69 
 
 		 1122 aa  135  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  24.66 
 
 		 1060 aa  133  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  25.42 
 
 		 1109 aa  131  8.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  23.56 
 
 		 1117 aa  114  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.68 
 
 		 961 aa  104  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  23.89 
 
 		 941 aa  101  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  23.89 
 
 		 941 aa  101  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  23.8 
 
 		 919 aa  101  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  25.16 
 
 		 962 aa  99.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  25 
 
 		 955 aa  99.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  23.02 
 
 		 960 aa  98.6  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  24.03 
 
 		 1172 aa  97.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  24.12 
 
 		 929 aa  95.9  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  23.4 
 
 		 940 aa  91.7  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  22.2 
 
 		 969 aa  91.3  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  22.5 
 
 		 941 aa  90.9  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  23.82 
 
 		 1172 aa  88.6  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  24.06 
 
 		 932 aa  88.2  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  27.67 
 
 		 1065 aa  87.8  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  34.42 
 
 		 1065 aa  84.7  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  34.42 
 
 		 1065 aa  84.7  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  21.8 
 
 		 922 aa  84  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  27.27 
 
 		 1187 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  22.71 
 
 		 915 aa  82.4  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  23.7 
 
 		 1194 aa  82.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  21.76 
 
 		 952 aa  81.6  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  27.65 
 
 		 945 aa  80.9  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  34.97 
 
 		 1037 aa  79.7  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  22.67 
 
 		 916 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  29.11 
 
 		 813 aa  80.1  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  22.67 
 
 		 915 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  22.01 
 
 		 921 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  26.05 
 
 		 1170 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  32.7 
 
 		 760 aa  78.6  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  34.81 
 
 		 1169 aa  78.2  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  32.65 
 
 		 972 aa  77  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  34.07 
 
 		 1169 aa  77  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  24.79 
 
 		 947 aa  76.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  25.17 
 
 		 1116 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  32.5 
 
 		 946 aa  75.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  23.17 
 
 		 958 aa  76.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  26.86 
 
 		 950 aa  75.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  34.43 
 
 		 1168 aa  75.5  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  25.08 
 
 		 1170 aa  75.1  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  23.18 
 
 		 958 aa  75.1  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  34.69 
 
 		 964 aa  74.7  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  26.05 
 
 		 1160 aa  74.3  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  30.39 
 
 		 1167 aa  73.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.21 
 
 		 966 aa  73.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  32.87 
 
 		 1043 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  33.86 
 
 		 774 aa  73.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  32.82 
 
 		 933 aa  73.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  33.33 
 
 		 1095 aa  72.8  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>