241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1928 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 235 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 200 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  35.75 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  35.53 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  33.48 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 251 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  47.67 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  34.23 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  30 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  46.25 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  50.85 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  28.96 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  55.38 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  61.36 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.29 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>