271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3168 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  100 
 
 
490 aa  959    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  43.8 
 
 
415 aa  193  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  40.5 
 
 
407 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  42.67 
 
 
409 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  42.86 
 
 
442 aa  160  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  35.38 
 
 
900 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  38.43 
 
 
519 aa  154  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  38.01 
 
 
300 aa  148  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  39.08 
 
 
285 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  39.08 
 
 
285 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  36.53 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  35.59 
 
 
314 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  32 
 
 
519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  30.13 
 
 
348 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  31.54 
 
 
334 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  34.74 
 
 
375 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  61.46 
 
 
478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  31.86 
 
 
520 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  40.88 
 
 
330 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  27.44 
 
 
533 aa  98.2  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  39.35 
 
 
846 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  33.52 
 
 
358 aa  95.5  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
1231 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  53.33 
 
 
545 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  25.81 
 
 
345 aa  94  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  44.95 
 
 
702 aa  90.1  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  47.01 
 
 
756 aa  90.1  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  22.71 
 
 
367 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  27.08 
 
 
360 aa  89.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  45.83 
 
 
449 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  40.5 
 
 
474 aa  87  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  31.63 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  31.63 
 
 
302 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  50.56 
 
 
673 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  48.18 
 
 
468 aa  84  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  50 
 
 
474 aa  83.6  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  41.67 
 
 
456 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  45.36 
 
 
451 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  47.42 
 
 
593 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  47.92 
 
 
349 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  44.19 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  32.42 
 
 
613 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  43.9 
 
 
460 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  40 
 
 
477 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7663  hypothetical protein  28.34 
 
 
366 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  44.79 
 
 
353 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  36.3 
 
 
694 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  36 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  46.51 
 
 
854 aa  75.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  42.31 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  39.39 
 
 
493 aa  75.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  27.63 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  29.58 
 
 
605 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  45.65 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  43.75 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  39.81 
 
 
847 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  39.1 
 
 
812 aa  73.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  45.88 
 
 
374 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0438  hypothetical protein  27.31 
 
 
426 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  41.05 
 
 
372 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  48.31 
 
 
900 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  34.93 
 
 
792 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  39.78 
 
 
774 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  47.06 
 
 
457 aa  70.5  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  31.03 
 
 
620 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  45.83 
 
 
655 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  42.11 
 
 
1194 aa  68.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  38.46 
 
 
491 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.7 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  31.16 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0986  hypothetical protein  29.71 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  30.73 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  33.16 
 
 
880 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  38.71 
 
 
459 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  41.67 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  38.3 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  40.21 
 
 
495 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  36.36 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.32 
 
 
984 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  41.24 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  31.2 
 
 
609 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  43.68 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  33.02 
 
 
455 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  30.42 
 
 
325 aa  67  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  37.36 
 
 
925 aa  66.6  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  43.16 
 
 
990 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.2 
 
 
886 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  40 
 
 
623 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  42.7 
 
 
688 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  40 
 
 
842 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  27.39 
 
 
321 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  47.44 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  51.76 
 
 
598 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  40.45 
 
 
518 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  44.79 
 
 
358 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  29.85 
 
 
322 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8589  hypothetical protein  28.8 
 
 
357 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  35.86 
 
 
727 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  31.82 
 
 
496 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  36.96 
 
 
880 aa  63.9  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>