More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08480 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  34.62 
 
 		 1196 aa  661    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  36.76 
 
 		 1197 aa  675    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  38.04 
 
 		 1148 aa  654    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  39.1 
 
 		 1188 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1292  transcription-repair coupling factor  66.47 
 
 		 1161 aa  1529    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  34.32 
 
 		 1169 aa  644    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08480  transcription-repair coupling factor Mfd  100 
 
 		 1155 aa  2355    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.13697  normal  0.343175 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  35.44 
 
 		 1176 aa  665    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  36.62 
 
 		 1169 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0638  transcription-repair coupling factor  36.93 
 
 		 1141 aa  649    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138681  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  39.44 
 
 		 1207 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0777  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  37.27 
 
 		 1194 aa  651    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  35.77 
 
 		 1176 aa  667    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  35.99 
 
 		 1178 aa  665    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  35.99 
 
 		 1176 aa  667    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  37.7 
 
 		 1176 aa  677    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  37.36 
 
 		 1169 aa  693    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  35.68 
 
 		 1176 aa  665    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  39.01 
 
 		 1168 aa  673    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0424  transcription-repair coupling factor  38.36 
 
 		 1210 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  53.99 
 
 		 1147 aa  1161    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  36.34 
 
 		 1157 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  51.09 
 
 		 1265 aa  648    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  36.23 
 
 		 1159 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07780  transcription-repair coupling factor Mfd  39.3 
 
 		 1212 aa  638    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.111573 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  35.76 
 
 		 1202 aa  652    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1948  transcription-repair coupling factor  37.34 
 
 		 1198 aa  650    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  36.85 
 
 		 1158 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05560  transcription-repair coupling factor Mfd  39.27 
 
 		 1218 aa  646    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  37.58 
 
 		 1165 aa  694    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  35.77 
 
 		 1176 aa  667    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  36.14 
 
 		 1179 aa  664    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  36.89 
 
 		 1153 aa  641    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  39.61 
 
 		 1183 aa  717    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  35.45 
 
 		 1176 aa  664    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  34.8 
 
 		 1174 aa  655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  37.73 
 
 		 1208 aa  653    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  35.8 
 
 		 1178 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0915  transcription-repair coupling factor  38.52 
 
 		 1179 aa  674    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0521422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  35.57 
 
 		 1170 aa  696    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  37.64 
 
 		 1154 aa  664    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  35.66 
 
 		 1176 aa  684    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  35.44 
 
 		 1176 aa  665    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  39.26 
 
 		 1183 aa  682    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  37.22 
 
 		 1197 aa  704    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  37.91 
 
 		 1211 aa  671    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  37.87 
 
 		 1211 aa  672    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  36.75 
 
 		 1168 aa  661    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32300  transcription-repair coupling factor Mfd  38.71 
 
 		 1199 aa  674    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.742659  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  35.59 
 
 		 1162 aa  698    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  35.41 
 
 		 1162 aa  699    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0665  transcription-repair coupling factor  39.16 
 
 		 1187 aa  661    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0064  transcription-repair coupling factor  37.38 
 
 		 1201 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862894  normal  0.0454923 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  39.23 
 
 		 1123 aa  681    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  35.81 
 
 		 1176 aa  667    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  37.62 
 
 		 1148 aa  667    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4525  transcription-repair coupling factor  38.38 
 
 		 1192 aa  691    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  38.98 
 
 		 1150 aa  677    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  36.08 
 
 		 1162 aa  681    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  37.24 
 
 		 1165 aa  655    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  36.11 
 
 		 1165 aa  658    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8585  transcription-repair coupling factor  37.59 
 
 		 1204 aa  643    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  35.34 
 
 		 1176 aa  670    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3479  transcription-repair coupling factor  35.75 
 
 		 1189 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.706369  normal  0.219385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  38.25 
 
 		 1182 aa  689    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1913  transcription-repair coupling factor  40.82 
 
 		 1192 aa  638    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  38.37 
 
 		 1164 aa  675    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  39.61 
 
 		 1246 aa  713    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3189  transcription-repair coupling factor  37.98 
 
 		 1218 aa  699    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.905154  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  36.65 
 
 		 1177 aa  684    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  37.87 
 
 		 1211 aa  672    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5241  transcription-repair coupling factor  38.64 
 
 		 1112 aa  672    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  37.96 
 
 		 1212 aa  675    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  36.78 
 
 		 1177 aa  693    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  35.34 
 
 		 1158 aa  635  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0909  transcription-repair coupling factor  39.37 
 
 		 1054 aa  635  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  36.11 
 
 		 1157 aa  634  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  38.12 
 
 		 1192 aa  632  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  35.16 
 
 		 1158 aa  629  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0073  transcription-repair coupling factor  34.45 
 
 		 1073 aa  628  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  35.93 
 
 		 1173 aa  629  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0017  transcription-repair coupling factor  37.31 
 
 		 1157 aa  623  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  35.37 
 
 		 1179 aa  625  1e-177  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  36.24 
 
 		 1192 aa  625  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  36.8 
 
 		 1188 aa  622  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  35.6 
 
 		 1153 aa  621  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  33.55 
 
 		 1175 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  36.38 
 
 		 1161 aa  617  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  36.8 
 
 		 1112 aa  618  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1013  transcription-repair coupling factor  45.8 
 
 		 1205 aa  616  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0526678 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  35.86 
 
 		 1150 aa  617  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  48.64 
 
 		 1193 aa  616  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  46.27 
 
 		 1222 aa  618  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  45.78 
 
 		 1224 aa  616  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  33.27 
 
 		 1167 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  33.27 
 
 		 1167 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  45.35 
 
 		 1234 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  36.12 
 
 		 1166 aa  613  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1642  transcription-repair coupling factor  35.08 
 
 		 1158 aa  611  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  34.45 
 
 		 1179 aa  612  1e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>