255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5977 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 271 aa  537  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  34.47 
 
 		 248 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 213 aa  95.9  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  40.85 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 190 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 192 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  34.25 
 
 		 213 aa  53.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  23.27 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 196 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 206 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 187 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 202 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 206 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 206 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 206 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 206 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 206 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 310 aa  48.9  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 203 aa  48.9  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  39.53 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 770 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 388 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  42.86 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 208 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 205 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>