More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01975 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1265  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 202 aa  101  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  28.95 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.8 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  50 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3261  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  48.98 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  46.81 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 256 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 420 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  26.45 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  46.15 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  45.65 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 391 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1436  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.940915  normal  0.193535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  32.22 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0292  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  42 
 
 		 403 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 400 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 470 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>